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Enregistrement W3209112511 · doi:10.1101/2021.11.04.466514

Expression of coffee florigen <i>CaFT1</i> reveals a sustained floral induction window associated with asynchronous flowering in tropical perennials

2021· preprint· en· W3209112511 sur OpenAlexafffund
Carlos Henrique Cardon, Raphael Ricon de Oliveira, Victoria Lesy, Thales Henrique Cherubino Ribeiro, Catherine Fust, Luísa Peloso Pereira, Joseph Colasanti, Antônio Chalfun-Júnior

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoInstituto Nacional de Ciência e Tecnologia do CaféUniversidade Federal de LavrasCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorUniversity of Guelph
Mots-clésBiologyPerennial plantArabidopsisBotanyLocus (genetics)AnthesisphotoperiodismCoffea arabicaGenePhenologyFlowering Locus CGeneticsCultivarMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The behavior of florigen(s) and environment-influenced regulatory pathways that control flowering in tropical perennials with complex phenological cycles is poorly understood. Understanding the mechanisms underlying this process is important for food production in the face of climate change. To explore this, homologs of Arabidopsis florigen FLOWERING LOCUS T ( CaFT1 ) and environment-related regulators CONSTANS ( CO ) , PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR 4 ( PIF4 ) and FLOWERING LOCUS C ( FLC ) were isolated from Coffea sp. L. (Rubiaceae). Overexpression of CaFT1 in Arabidopsis showed typical early-flowering and yeast two hybrid studies indicated CaFT1 binding to bZIP floral regulator, FD, demonstrates that CaFT1 is a coffee orthologue of florigen. Expression of CaFT1 and floral regulators were evaluated over one year using three contrasting genotypes: two C. arabica and one C. canephora . All genotypes showed active CaFT1 transcription from February until October, indicating a potential window for floral induction. CaCO expression, as expected, varied over the day period and monthly with day length, whereas expression of temperature-responsive homologs, CaFLC and CaPIF4 , did not correlate with temperature changes. Using coffee as a model, we suggest a continuum of floral induction that allows different starting points for floral activation, which explains developmental asynchronicity and prolonged anthesis events in tropical perennial species. Highlight Coffee florigen CaFT1 and related regulators revealed an extended floral induction window clarifying the asynchronicity and influence of environment for flowering in tropical perennial crops, providing perspectives to its control.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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