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Enregistrement W3209112801 · doi:10.14288/1.0402588

Host-mediated susceptibility of Pseudomonas aeruginosa to azithromycin

2021· article· en· W3209112801 sur OpenAlexaff
Corrie R. Belanger

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPseudomonas aeruginosaAzithromycinMicrobiologyHost (biology)BiologyVirologyAntibioticsBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This research assessed the ability and mechanism of azithromycin (AZM) alone, and in synergy, to treat Pseudomonas aeruginosa grown in physiologically relevant media and in vivo when compared to standard, nutrient rich conditions. When compared to treatment in Mueller Hinton broth (MHB), AZM has a substantially lower minimal inhibitory concentration (MIC) in RPMI ± human serum (RPMI/serum) and demonstrates increased synergy in combination with synthetic host defence peptides. Global transcriptional analysis revealed that genes mediating lipopolysaccharides (LPS) modification were downregulated in host-like media compared to MHB. Inactivation of these genes led to increased susceptibility to AZM and synergy between AZM and other antimicrobial agents. Thus indicating that dysregulation of LPS modification might result in increased AZM uptake in the host environment. Using Tn-Seq, mutants with severe growth defects under physiologically relevant conditions were determined. Genes involved in membrane integrity, iron acquisition, and nucleotide and cobalamin biosynthesis were implicated as required for survival under physiologically relevant conditions. The factors influencing growth of P. aeruginosa in physiologically relevant media were also essential in vivo, and may be used to explore alternative treatments that might take advantage or target these systems in the clinic. Finally, unique sets of genes important for susceptibility of P. aeruginosa to AZM under physiologically relevant media conditions and in vivo were identified using Tn-Seq in medium treated with AZM. Increased AZM susceptibility in murine abscess and human skin organoid models was observed for mutations in integral cell envelope genes, stress signaling and biofilm formation genes, type III secretion system genes, and transcriptional regulators. Most of the AZM susceptibility mutants had predicted interactions with iron acquisition components and increased susceptibility to AZM was induced as a function of iron limitation. Evidently, multiple factors in host-like environments are responsible for the observed changes in susceptibility of P. aeruginosa, including altered membrane permeability, altered iron availability, and stress responses. Understanding the mechanisms that underly bacterial susceptibility to antimicrobials in varying conditions could help change standard approaches to drug testing and lead to more complete and functional assays enabling more predictive drug discovery routes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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