Clinically Tractable Outcome Prediction of Non-WNT/Non-SHH Medulloblastoma Based on TPD52 IHC in a Multicohort Study
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Purpose: International consensus and the 2021 WHO classification recognize eight molecular subgroups among non-WNT/non-SHH (Group 3/4) medulloblastoma, representing approximately 60% of tumors. However, very few clinical centers worldwide possess the technical capabilities to determine DNA methylation profiles or other molecular parameters of high risk for group 3/4 tumors. As a result, biomarker-driven risk stratification and therapy assignment constitutes a major challenge in medulloblastoma research. Here, we identify an IHC marker as a clinically tractable method for improved medulloblastoma risk stratification. Experimental Design: We bioinformatically analyzed published medulloblastoma transcriptomes and proteomes identifying as a potential biomarker TPD52, whose IHC prognostic value was validated across three group 3/4 medulloblastoma clinical cohorts (n = 387) treated with conventional therapies. Results: TPD52 IHC positivity represented a significant independent predictor of early relapse and death for group 3/4 medulloblastoma [HRs between 3.67 and 26.7; 95% confidence interval (CI) between 1.00 and 706.23; P = 0.05, 0.017, and 0.0058]. Cross-validated survival models incorporating TPD52 IHC with clinical features outperformed existing state-of-the-art risk stratification schemes, and reclassified approximately 50% of patients into more appropriate risk categories. Finally, TPD52 immunopositivity was a predictive indicator of poor response to chemotherapy [HR, 12.66; 95% CI, 3.53–45.40; P < 0.0001], suggesting important implication for therapeutic choices. Conclusions: This study redefines the approach to risk stratification in group 3/4 medulloblastoma in global practice. Because integration of TPD52 IHC in classification algorithms significantly improved outcome prediction, this test could be rapidly adopted for risk stratification on a global scale, independently of advanced but technically challenging molecular profiling techniques.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».