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Enregistrement W3209225282 · doi:10.5281/zenodo.4710731

WU-BIMAC/NBOMicroscopyMetadataSpecs: 4DN-BINA-OME (NBO) Microscopy Metadata Specifications

2021· article· en· W3209225282 sur OpenAlexaff
Alessandro Rigano, Ulrike Boehm, James J. Chambers, Nathalie Gaudreault, Alison J. North, Jaime A. Pimentel, Damir Sudar, Peter Bajcsy, Claire M. Brown, Alexander D. Corbett, Orestis Faklaris, Judith Lacoste, Alex Laude, Glyn Nelson, David Grünwald, Caterina Strambio‐De‐Castillia

Notice bibliographique

RevueFreiDok plus (Universitätsbibliothek Freiburg) · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell Image Analysis Techniques
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetadataComputer scienceComputer graphics (images)World Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<em>Note: v2.01 is a minor release that corrects minor errors that were found in v2.00.</em> 4D<strong>N</strong>-<strong>B</strong>INA-<strong>O</strong>ME (NBO) Microscopy Metadata Specifications v2.0 is the result of a proposal put forth by the 4D Nucleome (4DN) Imaging Standards Working Group and by the Bioimaging North America (BINA) Quality Control and Data Management Working Group (QC-DM-WG) for a suite of tiered <strong>Microscopy Metadata Specifications</strong> that extend the October 2016 version of the OME Data Model schema. v2.0 supersedes and replaces v1.07 of the guidelines, which were called Microscopy Metadata 4DN Guidelines. The next version of the <strong>NBO Microscopy Metadata Specifications</strong> will be released as part of a community outreach effort conducted in collaboration with the Quality Assessment and Reproducibility for Light Microscopy (QUAREP-LiMi) initiative. <strong>Development continues!</strong> Everyone is encouraged to contribute to the next release v02-10 draft of the specifications. Click <strong>here</strong> for a shortcut to the model directory. To create an issue, click on Issues, the "New Issue" button, and select whether you are submitting a proposed new feature/element or want to propose a change to elements of the current proposal.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,516
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,004
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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