Transcriptome analysis revealed that delaying first colostrum feeding postponed ileum immune system development of neonatal calves
Notice bibliographique
Résumé
Our objective was to evaluate the effect of colostrum feeding times on genome-wide gene expression of neonatal calves. In total, twenty-seven calves were assigned to three colostrum feeding treatments: within 45 min (TRT0h, n = 9), 6 h (TRT6h, n = 9) and 12 h (TRT12h, n = 9). Ileum tissues were collected at 51 h and transcriptomic analysis was conducted. Uniquely expressed genes were identified in TRT0h group with enriched "Antigen Presentation" function. Meanwhile, the weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) identified four significant gene modules (|correlation| > 0.50 and P ≤ 0.05). In particular, Turquoise gene module with the enriched "Cadherin binding involved in cell-cell adhesion" and "Cell-cell adherences junction" GO terms were significantly correlated with Faecalibacterium prausnitzii (R = -0.70, P < 0.01) and Bifidobacterium (R = -0.55, P < 0.01). Our findings suggest feeding colostrum without delay could stimulate the expression of genes involved in immune function development related to host response and microbial colonization in neonatal claves.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».