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Enregistrement W3209439830 · doi:10.1101/2021.10.25.465663

Nuclear Export of <i>Drosophila</i> PERIOD contributes to temperature compensation of the circadian clock

2021· preprint· en· W3209439830 sur OpenAlexafffund
Astrid Giesecke, Peter S Johnstone, Angélique Lamaze, Johannes Landskron, Ezgi Atay, Ko‐Fan Chen, Deniz Top, Ralf Stanewsky

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCircadian rhythm and melatonin
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésCircadian clockCircadian rhythmBiologyCell biologyPeriod (music)CryptochromeNuclear export signalTimelessDrosophila melanogasterCLOCKClock networkBiophysicsNeuroscienceGeneticsCell nucleusGeneNucleusClock skewClock signalPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Circadian clocks are self-sustained molecular oscillators controlling daily changes of behavioral activity and physiology. For functional reliability and precision the frequency of these molecular oscillations must be stable at different environmental temperatures, known as ‘temperature compensation’. Despite being an intrinsic property of all circadian clocks, this phenomenon is not well understood at the molecular level. Here we use behavioral and molecular approaches to characterize a novel mutation in the period ( per ) clock gene of Drosophila melanogaster , which alters a predicted nuclear export sequence (NES) of the PER protein. We show that this new per I530A allele leads to progressively longer behavioral periods and clock oscillations with increasing temperature in both clock neurons and peripheral clock cells. While the mutant PER I530A protein shows normal circadian fluctuations and post-translational modifications at cool temperatures, increasing temperatures lead to both, severe amplitude dampening and hypophosphorylation of PER I530A . We further show that PER I530A displays reduced repressor activity at warmer temperatures, presumably because it cannot inactivate the transcription factor CLOCK (CLK). With increasing temperatures nuclear accumulation of PER I530A within clock neurons is increased, suggesting that PER is normally exported out of the nucleus at warm temperatures. Consequently, downregulating the nuclear export factor CRM1 also leads to temperature-dependent changes of behavioral rhythms. In summary, our results suggest that the PER NES and the nuclear export of clock proteins play an important role in temperature compensation of the Drosophila circadian clock.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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