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Enregistrement W3209447281 · doi:10.1101/2021.10.29.466449

Polarization and cell-fate decision facilitated by the adaptor Ste50 in <i>Saccharomyces cerevisiae</i>

2021· preprint· en· W3209447281 sur OpenAlexafffund
Nusrat Sharmeen, Chris Law, Cunle Wu

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensNational Research Council CanadaConcordia UniversityMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCell polaritySaccharomyces cerevisiaeCell cortexSignal transducing adaptor proteinCell biologyBiologyPolarization (electrochemistry)CellPheromoneYeastSignal transductionChemistryGeneticsCytoskeleton

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In response to pheromone, many proteins localize on the plasma membrane of yeast cell to reform it into a polarized shmoo structure. The adaptor protein Ste50, long known as a pheromone signal enhancer critical for shmoo polarization, has never been explored systematically for its localization and function in the polarization process. Time-lapse single-cell imaging and quantitation shown here characterizes Ste50p involvement in the establishment of cell polarity. We found early localization of Ste50p patches on the cell cortex that mark the point of shmoo initiation, these polarity sites move, and patches remain associated with the growing shmoo tip in a pheromone concentration timedependent manner until shmoo maturation. By quantitative analysis we show that polarization corelates with the rising levels of Ste50p, enabling rapid individual cell responses to pheromone that corresponds to a critical level of Ste50p at the initial G1 phase. We exploited the quantitative differences in the pattern of Ste50p expression to corelate with the cell-cell phenotypic heterogeneity showing Ste50p involvement in the cellular differentiation choice. Taken together, these findings present spatiotemporal localization of Ste50p during yeast polarization, suggesting that Ste50p is a component of the polarisome, and plays a critical role in regulating the polarized growth of shmoo during pheromone response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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