Developing Chenopodium ficifolium as a potential B genome diploid model system for genetic characterization and improvement of allotetraploid quinoa (Chenopodium quinoa)
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Quinoa (Chenopodium quinoa) is a high-value grain known for its excellent nutritional balance. It is an allotetraploid species (AABB, 2n = 4x = 36) formed by the hybridization between AA and BB genome diploid (2n = 2x = 18) species. This study reports genetic studies in Chenopodium ficifolium as a potential B genome diploid model system to simplify the genetic studies of quinoa including gene identification and marker-assisted breeding. RESULTS: Portsmouth, New Hampshire and Quebec City, Quebec accessions of C. ficifolium were used to develop an F2 population segregating for agronomically relevant traits including flowering time, plant height, the number of branches, branch angle, and internode length. Marker-trait associations were identified for the FLOWERING LOCUS T-LIKE 1 (FTL1) marker gene, where the alternate alleles (A1/A2) were segregating among the F2 generation plants in association with flowering time, plant height, and the number of branches. There was a strong correlation of the flowering time trait with both plant height and the number of branches. Thus, a possible multifaceted functional role for FTL1 may be considered. The parental Portsmouth and Quebec City accessions were homozygous for the alternate FTL1 alleles, which were found to be substantially diverged. SNPs were identified in the FTL1 coding sequence that could have some functional significance in relation to the observed trait variation. CONCLUSION: These results draw further attention to the possible functional roles of the FTL1 locus in Chenopodium and justify continued exploration of C. ficifolium as a potential diploid model system for the genetic study of quinoa. We expect our findings to aid in quinoa breeding as well as to any studies related to the Chenopodium genus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».