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Enregistrement W3209734224 · doi:10.1101/2021.11.04.21265866

Genetic analyses of the QT interval and its components in over 250K individuals identifies new loci and pathways affecting ventricular depolarization and repolarization

2021· preprint· en· W3209734224 sur OpenAlexaff
William J. Young, Najim Lahrouchi, Aaron Isaacs, ThuyVy Duong, Luisa Foco, Farah Ahmed, Jennifer A. Brody, Reem Salman, Raymond Noordam, Jan Walter Benjamins, Jeffrey Haessler, Leo‐Pekka Lyytikäinen, L. Repetto, Maria Pina Concas, Marten E. van den Berg, Stefan Weiß, Antoine Baldassari, Traci M. Bartz, James P. Cook, Daniel S. Evans, Rebecca Freudling, Oliver Hines, Jonas L. Isaksen, Honghuang Lin, Hao Mei, Arden Moscati, Martina Müller‐Nurasyid, Casia Nursyifa, Yong Qian, Anne Richmond, Carolina Roselli, Kathleen A. Ryan, Eduardo Tarazona‐Santos, Sébastien Thériault, Stefan van Duijvenboden, Helen Warren, Jie Yao, Dania Raza, Stefanie Aeschbacher, Gustav Ahlberg, Álvaro Alonso, Laura Andreasen, Joshua C. Bis, Eric Boerwinkle, Archie Campbell, Eulalia Catamo, Massimiliano Cocca, Michael J. Cutler, Dawood Darbar, Alessandro De Grandi, Antonio De Luca, Jun Ding, Christina Ellervik, Patrick T. Ellinor, Stephan B. Felix, Philippe Froguel, Christian Fuchsberger, Martin Gögele, Claus Graff, Mariaelisa Graff, Xiuqing Guo, Torben Hansen, Susan R. Heckbert, Paul L. Huang, Heikki V. Huikuri, Nina Hutri‐Kähönen, M. Arfan Ikram, Rebecca D. Jackson, Juhani Junttila, Maryam Kavousi, Jan A. Kors, Thiago Peixoto Leal, Rozenn N. Lemaître, Henry J. Lin, Lars Lind, Allan Linneberg, Simin Liu, Peter W. Macfarlane, Massimo Mangino, Thomas Meitinger, Massimo Mezzavilla, Pashupati P. Mishra, Rebecca Mitchell, Nina Mononen, May E. Montasser, Alanna C. Morrison, Matthias Nauck, Victor Nauffal, Pau Navarro, Kjell Nikus, Guillaume Paré, Kristen K. Patton, Giulia Pelliccione, Alan Pittman, David J. Porteous, Peter P. Pramstaller, Michael Preuß, Olli T. Raitakari, Alexander P. Reiner, Antônio Luiz Pinho Ribeiro, Kenneth Rice, Lorenz Risch, David Schlessinger, Ulrich Schotten, Claudia Schurmann, Xia Shen, M. Benjamin Shoemaker, Gianfranco Sinagra, Moritz F. Sinner, Elsayed Z. Soliman, Monika Stoll, Konstantin Strauch, Kirill V. Tarasov, Kent D. Taylor, Andrew Tinker, Stella Trompet, André G. Uitterlinden, Uwe Völker, Henry Völzke, Mélanie Waldenberger, Lu‐Chen Weng, Eric A. Whitsel, James G. Wilson, Christy L. Avery, David Conen, Adolfo Correa, Francesco Cucca, Marcus Dörr, Sina A. Gharib, Giorgia Girotto, Niels Grarup, Caroline Hayward, Yalda Jamshidi, Marjo‐Riitta Järvelin, J. Wouter Jukema, Stefan Kääb, Mika Kähönen, Jørgen K. Kanters, Charles Kooperberg, Terho Lehtimäki, Maria Fernanda Lima‐Costa, Yongmei Liu, Ruth J. F. Loos, Steven A. Lubitz, Dennis O. Mook‐Kanamori, Andrew P. Morris, Jeffrey R. O’Connell, Morten S. Olesen, Michele Orini, Sandosh Padmanabhan, Cristian Pattaro, Annette Peters, Bruce M. Psaty, Jerome I. Rotter, Bruno H. Stricker, Pim van der Harst, Cornelia M. van Duijn, Niek Verweij, James F. Wilson, Dan E. Arking, Julia Ramírez, Pier D. Lambiase, Nona Sotoodehnia, Borbála Mifsud, Christopher Newton‐Cheh, Patricia B. Munroe

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensUniversité LavalMcMaster UniversityPopulation Health Research InstituteCentre for Global Health Research
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésQT intervalRepolarizationSudden cardiac deathCardiologyInternal medicineQRS complexBiologyDepolarizationGenome-wide association studyGeneticsSingle-nucleotide polymorphismMedicineGenotypeGeneElectrophysiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The QT interval is an electrocardiographic measure representing the sum of ventricular depolarization (QRS duration) and repolarization (JT interval). Abnormalities of the QT interval are associated with potentially fatal ventricular arrhythmia. We conducted genome-wide multi-ancestry analyses in >250,000 individuals and identified 177, 156 and 121 independent loci for QT, JT and QRS, respectively, including a male-specific X-chromosome locus. Using gene-based rare-variant methods, we identified associations with Mendelian disease genes. Enrichments were observed in established pathways for QT and JT, with new genes indicated in insulin-receptor signalling and cardiac energy metabolism. In contrast, connective tissue components and processes for cell growth and extracellular matrix interactions were significantly enriched for QRS. We demonstrate polygenic risk score associations with atrial fibrillation, conduction disease and sudden cardiac death. Prioritization of druggable genes highlighted potential therapeutic targets for arrhythmia. Together, these results substantially advance our understanding of the genetic architecture of ventricular depolarization and repolarization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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