Contribution of the IdyllaTM System to Improving the Therapeutic Care of Patients with NSCLC through Early Screening of EGFR Mutations
Notice bibliographique
Résumé
Epidermal growth factor receptor (EGFR) genotyping, a critical examen for the treatment decisions of patients with non-small cell lung cancer (NSCLC), is commonly assayed by next-generation sequencing (NGS), but this global approach takes time. To determine whether rapid EGFR genotyping tests by the IdyllaTM system guides earlier therapy decisions, EGFR mutations were assayed by both the IdyllaTM system and NGS in 223 patients with NSCLC in a bicentric prospective study. IdyllaTM demonstrated agreement with the NGS method in 187/194 cases (96.4%) and recovered 20 of the 26 (77%) EGFR mutations detected using NGS. Regarding the seven missed EGFR mutations, five were not detected by the IdyllaTM system, one was assayed in a sample with insufficient tumoral cells, and the last was in a sample not validated by the IdyllaTM system (a bone metastasis). IdyllaTM did not detect any false positives. The average time between EGFR genotyping results from IdyllaTM and the NGS method was 9.2 ± 2.2 working days (wd) (12.6 ± 4.0 calendar days (cd)). Subsequently, based on the IdyllaTM method, the timeframe from tumor sampling to the initiation of EGFR-TKI was 7.7 ± 1.2 wd (11.4 ± 3.1 cd), while it was 20.3 ± 6.7 wd (27.2 ± 8.3 cd) with the NGS method (p < 0.001). We thus demonstrated here that the IdyllaTM system contributes to improving the therapeutic care of patients with NSCLC by the early screening of EGFR mutations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».