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Enregistrement W3209998734 · doi:10.1016/j.bbagen.2021.130045

Mutational analysis of TlyA from Brachyspira hampsonii reveals two key residues conserved in pathogenic bacteria responsible for oligomerization and hemolytic activity

2021· article· en· W3209998734 sur OpenAlexafffund
Brandon A. Keith, John C. S. Harding, Matthew E. Loewen

Notice bibliographique

RevueBiochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueVeterinary medicine and infectious diseases
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Agriculture and ForestryMinistry of Agriculture - Saskatchewan
Mots-clésMutantHemolysisMutagenesisBiochemistryVirulenceBiologyGeneMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: TlyA proteins are expressed in a variety of pathogenic bacteria and possess dual hemolytic and ribosomal RNA methyltransferase functions. While the mechanism of TlyA mediated rRNA methylation is well understood, relatively little is known about the mechanism of TlyA induced hemolysis. METHODS: TlyA protein from the pig pathogen Brachyspira hampsonii was heterologously expressed and purified from an E. coli host. Hemolytic activity and rRNA methylation were assessed in vitro. Site-directed mutagenesis was used to mutate amino acids believed to be involved in TlyA mediated hemolysis. RESULTS: Purified TlyA-His protein exhibited both hemolytic and rRNA methyltransferase activities in vitro, with partial inhibition of hemolysis observed under reducing conditions. Mutation of cysteine 80 to alanine impaired hemolytic activity. A C27A/C93A mutant was capable of dimerizing under non-reducing conditions, indicating that a C80-C80 disulfide bond is involved in TlyA oligomerization. A mutation conserved in several avirulent Brachyspira species (S9K) completely abolished hemolytic activity of TlyA. This loss of activity was attributed to impaired oligomerization in the S9K mutant, as assessed by ITC and size-exclusion chromatography experiments. CONCLUSIONS: Oligomeric assembly and hemolytic activity of TlyA from Brachyspira hampsonii is dependent on the formation of an intermolecular C80-C80 disulfide bond and noncovalent interactions involving serine 9. The conservation of these amino acids in TlyA proteins from pathogenic bacteria suggests a correlation between tlyA gene mutations and bacterial virulence. GENERAL SIGNIFICANCE: Our results further elucidate the mechanisms underlying TlyA mediated hemolysis and provide evidence of a conserved mechanism of oligomerization for TlyA family proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,475
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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