In the Asia-Pacific region, the COI DNA test revealed the divergence of the bivalve mollusc Mactra chinensis into three species; can these species be distinguished using shell coloration and sperm structure?
Notice bibliographique
Résumé
Abstract According to COI DNA barcoding testing, the marine bivalve mollusc Mactra chinensis, which is native to the Asia-Pacific region, diverged into three species. These species were preliminary characterized as M. chinensis COI clade I, M. chinensis COI clade II and M. chinensis COI clade III. To find out whether it is possible to morphologically distinguish samples representing genetic clades, we examined the color of the shells and the structure of the spermatozoa. It was found that the number of detected coloration types exceeds the number of detected species. In addition, it was shown that individuals belonging to the same genetic clade can have shells of different colors. Consequently, it is impossible to choose one type of shell coloration as a species-specific trait. For sperm, the sperm morphological patterns found in each of the three species are consistent with the M. chinensis sperm model described in previous reports. However, the single sperm variant is also not applicable to discriminate between species derived from M. chinensis, since heterogeneous variants of spermatozoa differing in the length of the acrosomal rod were found. We hypothesized that genetic divergence of species could cause a shift towards predominance of one of the sperm variants, and that species-specific sperm morphs could be quantitatively dominant in molluscs belonging to different clades. However, the dominant sperm morphs were the same in COI clade I and COI clade III. Thus, dominant sperm morphs are useless as species-specific traits. However, shell color and sperm parameters are specific to different geographic regions, and it seems that unique environmental factors can determine shell color and sperm morphology. As a result, both shells and spermatozoa can be used to distinguish the geographical forms of M. chinensis, regardless of the belonging of the forms to a particular genetic clade. Here we propose the introduction of geographic identifiers, in which the shell color and parameters of sperm sets are used as morphological criteria to determine the geographical origin of mollusc specimens belonging to the M. chinensis species complex.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».