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Enregistrement W3210151021 · doi:10.1038/s41467-021-26545-9

A Slam-dependent hemophore contributes to heme acquisition in the bacterial pathogen Acinetobacter baumannii

2021· article· en· W3210151021 sur OpenAlexafffund
Thomas J. Bateman, Megha Shah, Timothy Pham Ho, Hyejin Esther Shin, Chuxi Pan, Greg Harris, Jamie E. Fegan, Epshita A. Islam, Sang Kyun Ahn, Yogesh Hooda, Scott D. Gray‐Owen, Wangxue Chen, Trevor F. Moraes

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensNational Research Council CanadaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCIHR Skin Research Training CentreCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of TorontoGovernment of CanadaCanadian Light SourceUniversity of Washington
Mots-clésAcinetobacter baumanniiPathogenHemeMicrobiologyAcinetobacterBiologyPathogenic organismBacteriaGeneticsAntibioticsPseudomonas aeruginosaBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nutrient acquisition systems are often crucial for pathogen growth and survival during infection, and represent attractive therapeutic targets. Here, we study the protein machinery required for heme uptake in the opportunistic pathogen Acinetobacter baumannii. We show that the hemO locus, which includes a gene encoding the heme-degrading enzyme, is required for high-affinity heme acquisition from hemoglobin and serum albumin. The hemO locus includes a gene coding for a heme scavenger (HphA), which is secreted by a Slam protein. Furthermore, heme uptake is dependent on a TonB-dependent receptor (HphR), which is important for survival and/or dissemination into the vasculature in a mouse model of pulmonary infection. Our results indicate that A. baumannii uses a two-component receptor system for the acquisition of heme from host heme reservoirs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,859
Score d'incertitude au seuil0,453

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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