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Enregistrement W3210681284 · doi:10.1016/j.jim.2021.113171

Novel in vitro invariant natural killer T cell functional assays

2021· article· en· W3210681284 sur OpenAlexafffund
Allison L. Balasko, Colin Graydon, Keith R. Fowke

Notice bibliographique

RevueJournal of Immunological Methods · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésCD1DPeripheral blood mononuclear cellCytokineImmune systemImmunologyNatural killer T cellBiologyIn vitroT cellChemistryCell biologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Invariant Natural Killer T (iNKT) cells are innate lymphocytes bridging the innate and adaptive immune systems and are critical first responders against cancer and infectious diseases. iNKT cell phenotype and functionality are studied using in vitro stimulation assays assessing cytokine response and proliferation capabilities. The most common stimulant is the glycolipid α-Galactosyl Ceramide (α-GalCer), which stimulates iNKT cells when presented by CD1d, an MHC class I-like molecule expressed by antigen-presenting cells (APC). Another stimulant used is α-GalCer-loaded DimerX, a CD1d-Ig fusion protein which stimulates iNKT cells in an APC-independent fashion. Here, we demonstrate use of the PBS-57-loaded CD1d-tetramer as an APC-independent stimulant, where PBS-57 is an α-GalCer analogue. METHODS: Using healthy fresh (n = 4) and frozen (n = 7) peripheral blood mononuclear cells (PBMCs), 10-h cytokine response (measuring IFN-γ production) and 10-day proliferation assays were performed assessing iNKT functionality using α-GalCer, CD1d-tetramer and DimerX stimulants. RESULTS: All stimulants effectively induced IFN-γ production in both fresh and frozen PBMC. After the 10-h activation, CD1d-tetramer was significantly more effective than α-GalCer (p = 0.032) in inducing IFN-γ production in fresh PBMC and significantly more effective than both α-GalCer (p = 0.004) and DimerX (p = 0.021) in frozen PBMC. Similarly, all stimulants induced strong proliferation responses in all samples, although this was only significant in the frozen PBMC. No significant differences in proliferation were observed between stimulants. SIGNIFICANCE: This study supports PBS-57-loaded CD1d-tetramer as an effective in vitro APC-independent iNKT cell stimulant, which is comparable to or even more effective than α-GalCer and DimerX. As CD1d is downregulated during infectious disease and cancer as evasion strategies, in vitro assays which are APC-independent can assist in providing objective insight to iNKT activation by not relying on CD1d expression by APCs. Overall, the novel CD1d-tetramer stimulation equips researchers with an expanded "toolkit" to successfully assess iNKT cell function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,383
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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