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Enregistrement W3210918787 · doi:10.5281/zenodo.3246569

Supplementary Material for "Dynamic Modelling of Phosphorolytic Cleavage Catalyzed by Pyrimidine-Nucleoside Phosphorylase"

2019· article· en· W3210918787 sur OpenAlexaff
Robert T. Giessmann, Niels Krausch, Felix Kaspar, Mariano Nicolás Cruz Bournazou, Anke Wagner, Peter Neubauer, Matthias Gimpel

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Molecular Research
Établissements canadiensInstitute of Aging
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPurine nucleoside phosphorylaseNucleosidePyrimidineCleavage (geology)Thymidine phosphorylaseChemistryBiochemistryBiologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Supplementary Material our publication: Giessmann, R.T.; Krausch, N.; Kaspar, F.; Cruz Bournazou, M.N.; Wagner, A.; Neubauer, P.; Gimpel, M. Dynamic Modelling of Phosphorolytic Cleavage Catalyzed by Pyrimidine-Nucleoside Phosphorylase. Processes 2019, 7, 380. doi: 10.3390/pr7060380 The .pdf file contains the supplementary material, i.e. Figure S1: Further mixtures of deoxythymidine/thymine, and “predicted vs actual” plot, Table S1: Experimental conditions in this study, Figure S2: Decomposition Degradation progress of deoxyribose-1-phosphate at elevated temperatures, Figure S3: Fits of all experiments, Figure S4: Comparison of inter-day controls. The .zip file contains all necessary data and software code to reproduce all Figures, including the original one from the publication and the one from the Supporting Information.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,563
Score d'incertitude au seuil0,623

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,5630,108

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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