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Enregistrement W3210985795 · doi:10.1002/leg3.130

<i>Pectin acetylesterase 8</i> influences pectin acetylation in the seed coat, seed imbibition, and dormancy in common bean (<scp><i>Phaseolus vulgaris</i></scp> L.)

2021· article· en· W3210985795 sur OpenAlexafffund
Jeffrey Palmer, Aga Pajak, Blake Robson, Bailing Zhang, Jaya Joshi, Marwan Diapari, K. Peter Pauls, Frédéric Marsolais

Notice bibliographique

RevueLegume Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant pathogens and resistance mechanisms
Établissements canadiensUniversity of GuelphWestern UniversityAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésPhaseolusGerminationCoatBiologyPectinDormancySeed dormancyImbibitionAlleleGeneBotanyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The results of a prior transcript profiling study identified a large difference in transcript accumulation of a pectin acetylesterase gene, designated as PAE8, in two genetically related lines of common bean (Phaseolus vulgaris). The results of reverse transcription‐quantitative PCR experiments confirmed this difference and revealed that the gene is expressed specifically in the seed coat of developing seeds. Genomic sequence data identified a non‐functional allele, due to a five‐base pair insertion resulting in a frameshift and premature stop codon. The non‐functional pae8 allele was associated with a lack of detectable protein as determined by Western blot. PAE8 accounted for approximately 65% of total pectin acetylesterase activity in the developing seed coat. Lack of functional PAE8 resulted in an approximately 2.5‐fold increase in acetylation of soluble pectin in the mature seed coat. The presence of a non‐functional pae8 allele was associated with an increased rate of water absorption by the seed and increased percentage of germination in aged seeds. The data suggest that the decreased acetylation of pectin leads to enhanced interaction with Ca2+, contributing to water impermeability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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