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Enregistrement W3211009370 · doi:10.3389/fphys.2021.763584

From Millimeters to Micrometers; Re-introducing Myocytes in Models of Cardiac Electrophysiology

2021· article· en· W3211009370 sur OpenAlexaff
Karoline Horgmo Jæger, Andrew G. Edwards, Wayne R. Giles, Aslak Tveito

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Physiology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBidomain modelCardiac electrophysiologyElectrophysiologyMyocyteCardiac myocyteIn silicoBiological systemCardiac action potentialComputer scienceNeuroscienceComputational modelThermal conductionPhysicsBiophysicsChemistryBiologyRepolarizationMedicineSimulationInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

analysis of electrochemical wave dynamics in cardiac tissue is limited by the homogenization procedure (spatial averaging) intrinsic to standard continuum models of conduction. Averaged models cannot resolve the intricate dynamics in the vicinity of individual cardiomyocytes simply because the myocytes are not present in these models. Here we demonstrate how recently developed mathematical models based on representing every myocyte can significantly increase the accuracy, and thus the utility of modeling electrophysiological function and dysfunction in collections of coupled cardiomyocytes. The present gold standard of numerical simulation for cardiac electrophysiology is based on the bidomain model. In the bidomain model, the extracellular (E) space, the cell membrane (M) and the intracellular (I) space are all assumed to be present everywhere in the tissue. Consequently, it is impossible to study biophysical processes taking place close to individual myocytes. The bidomain model represents the tissue by averaging over several hundred myocytes and this inherently limits the accuracy of the model. In our alternative approach both E, M, and I are represented in the model which is therefore referred to as the EMI model. The EMI model approach allows for detailed analysis of the biophysical processes going on in functionally important spaces very close to individual myocytes, although at the cost of significantly increased CPU-requirements.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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