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Enregistrement W3211074990 · doi:10.1101/2021.10.14.21264843

Towards Optimum Reporting of Pulmonary Effectiveness Databases and Outcomes (TORPEDO): identifying a core dataset for asthma and COPD studies

2021· preprint· en· W3211074990 sur OpenAlexaff
Job F. M. van Boven, Sarah Lucas, Gary Parker, Alan Kaplan, Antigona Trofor, Billie Bonevski, Bruce Kirenga, Dermot Ryan, Emílio Pizzichini, Éric Van Ganse, Erick Wan-Chun Huang, Evelyn A Brakema, Gillian S. Gould, Janwillem Kocks, Jennifer Alison, Jennifer K Quint, Joan B. Soriano, John R. Hurst, Kamran Siddiqi, Katherine Boydell, Marc Miravitlles, Mario Alberto Flores-Valdez, Marise J. Kasteleyn, Mark Fitzgerald, Melanie Boeckmann, Michael Chaiton, Miguel Román-Rodríguez, Muralidhar M Kulkarni, Nicolás Roche, Niels H. Chavannes, Nikolaos G. Papadopoulos, Panagiotis Behrakis, Sarah Dennis, Shalini Bassi, Siân Williams, Toby M. Maher, Trishul Siddharthan, Veena Kamath, Katia Verhamme

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueDelphi Technique in Research
Établissements canadiensCancer Care OntarioVancouver Coastal HealthHealth CanadaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesRespiratory Effectiveness Group
Mots-clésCOPDAsthmaMedicineDelphi methodChecklistVotingDelphiPhysical therapyComputer scienceInternal medicinePsychologyArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Purpose There remains a need for a standardized dataset for respiratory studies to accelerate data collection, improve research efficiency and aid the sharing, merging and comparison of datasets. This TORPEDO (Towards Optimum Reporting of Pulmonary Effectiveness Databases and Outcomes) project aimed to develop a checklist of optimum and minimum variables for asthma and chronic obstructive pulmonary disease (COPD) research. Methods A 3-phase modified Delphi survey was conducted: in phase 1, an expert panel generated a list of variables, in phase 2 a Delphi panel selected the minimum variables (>66% agreement) for any design and in phase 3 they were asked to select a minimum set for specific study designs. Results In phase 1 the expert panel (n=22) proposed 224 variables. In phase 2, voting by 64 participants resulted in consensus (>66% agreement) for 18 variables and partial agreement (50-66%) for 44 variables, following this, 5 technical variables (e.g. date of test) were removed. In phase 3, 34 members of the Delphi panel completed voting; consensus was reached for 13 variables for retrospective asthma studies and 34 for prospective asthma studies. For COPD, there were 16 variables for retrospective studies and 37 for prospective studies. Gender, asthma/COPD exacerbations and patient-reported outcomes were the only variables with 100% agreement for both asthma and COPD studies. Conclusion The proposed list of minimally required variables will allow the assessment of current data sources for their utility in asthma and COPD studies, facilitate the merging of datasets, aid standardization of data collection and improve research efficiency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,719
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,704
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,281
Score d'incertitude au seuil0,346

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,7190,704
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,005
Bibliométrie0,0170,014
Études des sciences et des technologies0,0040,005
Communication savante0,0180,018
Science ouverte0,0080,036
Intégrité de la recherche0,0030,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,401
Tête enseignante GPT0,545
Écart entre enseignants0,144 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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