Development of a rapid, internally controlled, two target, real-time RT-PCR for detection of measles virus
Notice bibliographique
Résumé
Vaccination has greatly reduced global measles incidence, however measles remains endemic in many regions worldwide. Measles surveillance relies on high performance molecular detection of the virus. We have developed and validated a multiplex rRT-PCR assay for the detection of measles virus. The assay includes three independent probes with unique reporter dyes for the simultaneous detection of the measles hemagglutinin gene, nucleoprotein gene and endogenous RNaseP control. Using dilution series of synthetic RNAs the limits of detection were determined to be approximately 20 copies of measles RNA. The assay is extremely reproducible with very low intra-assay and inter-assay coefficients of varation for both the N and the H targets. After testing 68 confirmed measles positive and 86 measles negative archival clinical samples our data shows the multiplex assay has a sensitivity and specificity of 100 %, and a 100 % concordance with the expected results. No cross reactivity was identified with clinical specimens positive for six other viruses. According to the WHO, currently only the B3, D4, D8, H1 measles genotypes of the 24 recognized genotypes continue to circulate and this new multiplex assay successfully detected all four of those genotypes as well as six other genotypes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».