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Enregistrement W3211315038 · doi:10.1016/j.ajhg.2021.10.002

Bi-allelic variants in the mitochondrial RNase P subunit PRORP cause mitochondrial tRNA processing defects and pleiotropic multisystem presentations

2021· article· en· W3211315038 sur OpenAlexaff
Irit Hochberg, Leigh Demain, Julie Richer, Kyle Thompson, Jill Urquhart, Alessandro Rea, Waheeda Pagarkar, Agustí Rodríguez‐Palmero, Agatha Schlüter, Edgard Verdura, Aurora Pujol, Pilar Quijada‐Fraile, Albert Amberger, Andrea Deutschmann, Sandra Demetz, Meredith Gillespie, Inna A. Belyantseva, Hugh J. McMillan, Melanie Barzik, Glenda M. Beaman, Reeya Motha, Kah Ying Ng, James O’Sullivan, Simon G. Williams, Sanjeev S. Bhaskar, Isabella Rachel Lawrence, Emma M. Jenkinson, Jessica L. Zambonin, Zeev Blumenfeld, Sergey Yalonetsky, Stephanie Oerum, Walter Rossmanith, Wyatt W. Yue, Johannes Zschocke, Kevin J. Munro, Brendan J. Battersby, Thomas B. Friedman, Robert W. Taylor, Raymond T. O’Keefe, William G. Newman

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Human Genetics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensUniversity of OttawaChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesManchester Biomedical Research CentreNational Institute for Health and Care ResearchAction Medical ResearchRoyal National Institute for Deaf PeopleWellcome Trust
Mots-clésRNase PBiologyTransfer RNARNase MRPMitochondrial DNAMitochondrionProtein subunitMitochondrial diseasePhenotypeGeneticsMolecular biologyAlleleRNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human mitochondrial RNase P (mt-RNase P) is responsible for 5' end processing of mitochondrial precursor tRNAs, a vital step in mitochondrial RNA maturation, and is comprised of three protein subunits: TRMT10C, SDR5C1 (HSD10), and PRORP. Pathogenic variants in TRMT10C and SDR5C1 are associated with distinct recessive or x-linked infantile onset disorders, resulting from defects in mitochondrial RNA processing. We report four unrelated families with multisystem disease associated with bi-allelic variants in PRORP, the metallonuclease subunit of mt-RNase P. Affected individuals presented with variable phenotypes comprising sensorineural hearing loss, primary ovarian insufficiency, developmental delay, and brain white matter changes. Fibroblasts from affected individuals in two families demonstrated decreased steady state levels of PRORP, an accumulation of unprocessed mitochondrial transcripts, and decreased steady state levels of mitochondrial-encoded proteins, which were rescued by introduction of the wild-type PRORP cDNA. In mt-tRNA processing assays performed with recombinant mt-RNase P proteins, the disease-associated variants resulted in diminished mitochondrial tRNA processing. Identification of disease-causing variants in PRORP indicates that pathogenic variants in all three subunits of mt-RNase P can cause mitochondrial dysfunction, each with distinct pleiotropic clinical presentations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,722
Score d'incertitude au seuil0,369

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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