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Enregistrement W3211589375 · doi:10.1021/acs.jpcb.1c06637

Permeability and Osmotic Parameters of Human Umbilical Vein Endothelial Cells and H9C2 Cells under Non-ideal Thermodynamic Assumptions: A Novel Iterative Fitting Method

2021· article· en· W3211589375 sur OpenAlexafffund
Laura A. Gabler Pizarro, Locksley E. McGann, Janet A.W. Elliott

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2021
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAdvanced Thermodynamics and Statistical Mechanics
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCryoprotectantCryopreservationUmbilical veinIntracellularCryobiologyPermeability (electromagnetism)ThermodynamicsBiophysicsChemistryMaterials scienceMembraneBiologyBiochemistryCell biologyPhysicsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cryopreservation is the use of very low subzero temperatures to preserve cells and tissues for later use. This is achieved by controlled cooling in the presence of cryoprotectants that moderate the amount of ice formed. Mathematical modeling of the cryopreservation process is a useful tool to investigate the different variables that affect the results of this process. The changing cell volume during cryopreservation can be modeled using cell membrane water and cryoprotectant permeabilities and the osmotically inactive fraction of the intracellular contents. These three cell-specific parameters have been found previously for different cell types under ideal and dilute assumptions, but biological solutions at subzero temperatures are far from ideal and dilute, especially when cryoprotectants are included. In this work, the osmotic virial equation is used to model the changing cell volume under non-ideal assumptions, and the intracellular environment is described using the grouped solute, which consists of all impermeant intracellular solutes grouped together, leading to two additional cell-specific parameters, the second and third osmotic virial coefficients of the grouped solute. Herein, we present a novel fitting method to efficiently determine these five cell-specific parameters by fitting kinetic cell volume data under non-ideal assumptions and report the results of applying this method to obtain the parameters for two cell types: human umbilical vein endothelial cells and H9C2 rat myoblasts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,315
Score d'incertitude au seuil0,542

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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