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Enregistrement W3211625894 · doi:10.1111/2041-210x.13756

<i>allodb</i> : An R package for biomass estimation at globally distributed extratropical forest plots

2021· article· en· W3211625894 sur OpenAlexaff
Erika Gonzalez‐Akre, Camille Piponiot, Mauro Lepore, Valentine Herrmann, James A. Lutz, Jennifer L. Baltzer, Christopher W. Dick, Gregory S. Gilbert, Fangliang He, Michael Heym, Alejandra I. Huerta, Patrick A. Jansen, Daniel J. Johnson, Nikolai Knapp, Kamil Král, Dunmei Lin, Yadvinder Malhi, Sean M. McMahon, Jonathan A. Myers, David A. Orwig, Diego I. Rodríguez‐Hernández, Sabrina E. Russo, Jessica Shue, Xugao Wang, Amy Wolf, Yang Tong-hui, Stuart J. Davies, Kristina J. Anderson‐Teixeira

Notice bibliographique

RevueMethods in Ecology and Evolution · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueForest ecology and management
Établissements canadiensAlberta Biodiversity Monitoring InstituteUniversity of AlbertaWilfrid Laurier University
Organismes subventionnairesSmithsonian Institution
Mots-clésTree allometryBiomass (ecology)Range (aeronautics)Environmental scienceForest inventoryExtratropical cycloneTaigaEcologyTree (set theory)MathematicsForest managementMeteorologyGeographyBiologyAgroforestryBiomass partitioning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Allometric equations for calculation of tree above‐ground biomass ( AGB ) form the basis for estimates of forest carbon storage and exchange with the atmosphere. While standard models exist to calculate forest biomass across the tropics, we lack a standardized tool for computing AGB across boreal and temperate regions that comprise the global extratropics. Here we present an integrated R package, allodb , containing systematically selected published allometric equations and proposed functions to compute AGB . The data component of the package is based on 701 woody species identified at 24 large Forest Global Earth Observatory (ForestGEO) forest dynamics plots representing a wide diversity of extratropical forests. A total of 570 parsed allometric equations to estimate individual tree biomass were retrieved, checked and combined using a weighting function designed to ensure optimal equation selection over the full tree size range with smooth transitions across equations. The equation dataset can be customized with built‐in functions that subset the original dataset and add new equations. Although equations were curated based on a limited set of forest communities and number of species, this resource is appropriate for large portions of the global extratropics and can easily be expanded to cover novel forest types.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,027
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil0,209

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,027
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0620,039

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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