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Enregistrement W3211763077 · doi:10.1055/s-0041-1736567

Disease Progression and Mutation Pattern in a Large Cohort of LGMD R1/LGMD 2A Patients from India

2021· article· en· W3211763077 sur OpenAlexaff
Kiran Polavarapu, Mainak Bardhan, Veeramani Preethish‐Kumar, Leena Shingavi, Ram Murthy Anjanappa, Seena Vengalil, Saraswati Nashi, Gautham Arunachal, Swetha Gunasekaran, Dhaarini Mohan, Sanita Raju, Gopikrishnan Unnikrishnan, Akshata Huddar, Valasani Ravi-Kiran, Priya Treesa Thomas, Atchayaram Nalini

Notice bibliographique

RevueGlobal Medical Genetics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCalpain Protease Function and Regulation
Établissements canadiensOttawa HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineMissense mutationCohortProbandLimb-girdle muscular dystrophyFamily historyInternal medicinePediatricsWeaknessAge of onsetCompound heterozygosityDiseaseSurgeryMutationGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Calpainopathy is caused by mutations in the CAPN3. There is only one clinical and genetic study of CAPN3 from India and none from South India. A total of 72 (male[M]:female [F] = 34:38) genetically confirmed probands from 72 independent families are included in this study. Consanguinity was present in 54.2%. The mean age of onset and duration of symptoms are 13.5 ± 6.4 and 6.3 ± 4.7 years, respectively. Positive family history occurred in 23.3%. The predominant initial symptoms were proximal lower limb weakness (52.1%) and toe walking (20.5%). At presentation, 97.2% had hip girdle weakness, 69.4% had scapular winging, and 58.3% had contractures. Follow-up was available in 76.4%, and 92.7% were ambulant at a mean age of 23.7 ± 7.6 years and duration of 4.5 years, remaining 7.3% became wheelchair-bound at 25.5 ± 5.7 years of age (mean duration = 13.5 ± 4.6), 4.1% were aged more than 40 years (duration range = 5–20). The majority remained ambulant 10 years after disease onset. Next-generation sequencing (NGS) detected 47 unique CAPN3 variants in 72 patients, out of which 19 are novel. Missense variants were most common occurring in 59.7% (homozygous = 29; Compound heterozygous = 14). In the remaining 29 patients (40.3%), at least one suspected loss of function variant was present. Common recurrent variants were c.2051–1G > T and c.2338G > C in 9.7%, c.1343G > A, c.802–9G > A, and c.1319G > A in 6.9% and c.1963delC in 5.5% of population. Large deletions were observed in 4.2%. Exon 10 mutations accounted for 12 patients (16.7%). Our study highlights the efficiency of NGS technology in screening and molecular diagnosis of limb-girdle muscular dystrophy with recessive form (LGMDR1) patients in India.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,068
Score d'incertitude au seuil0,338

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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