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Enregistrement W3211857898 · doi:10.1097/pai.0000000000000988

Testing Algorithms for the Diagnosis of Malignant Glandular Tumors of the Uterine Cervix Histotyped per the International Endocervical Adenocarcinoma Criteria and Classification (IECC) System

2021· article· en· W3211857898 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueApplied immunohistochemistry & molecular morphology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEndometrial and Cervical Cancer Treatments
Établissements canadiensLions Gate HospitalAlberta Health ServicesMcMaster UniversityCalgary Laboratory ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésAdenocarcinomaMedical diagnosisEstrogen receptorCervixConfidence intervalProgesterone receptorCarcinomaMucin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The International Endocervical adenocarcinoma Criteria and Classification (IECC) categorizes tumors into human papilloma virus (HPV) associated (HPVA), not associated (NHPV), and invasive adenocarcinoma not otherwise specified (IA NOS). HPVA and NHPV encompass 11 histotypes and an algorithm of mucin content, HPV ribonucleic acid (RNA), estrogen receptor and GATA3 is proposed for the diagnosis of most. In this study, the IECC algorithm's diagnoses were compared with hematoxylin and eosin (H&E) based IECC histotyping. Kappa statistics measured performance agreement. With additional markers, hierarchical clustering by random forest (RF) classification identified the most discriminating between tumor types, and investigated other algorithms. Three pathologists independently reviewed digitized H&E images of n=152 primary cervical adenocarcinomas for IECC histotype and mucin content, and tissue microarrays for expression of HPV RNA by in situ hybridization and 16 antibodies by immunohistochemistry. Results were finalized by consensus. There were n=113 HPVA, n=22 NHPV, and n=17 IA NOS. Mucin was obvious in n=36 and limited in n=116. Among n=124 with satisfactory test results, HPV RNA was positive in n=96, estrogen receptor in n=72, and GATA3 in n=15. The IECC algorithm diagnosed n=99 which agreed with H&E histotyping in n=64 for a fair κ of 0.36 (95% confidence interval, 0.21-0.50): n=12 were undiagnosed and n=13 were IA NOS. Small sample sizes restricted RF to HPVA versus NHPV which were discriminated by p16, HPV RNA, and MUC6 with an area under the curve of 0.74 (95% confidence interval, 0.58-0.90). The IECC algorithm for histotyping under-performed. The RF algorithmin for categorization was favorable, but validation in larger studies and investigation of additional algorithms to discriminate between all IECC histotypes are needed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,111
Score d'incertitude au seuil0,423

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
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