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Enregistrement W3211873923 · doi:10.1371/journal.pone.0259970

Modelling COVID-19 transmission in a hemodialysis centre using simulation generated contacts matrices

2021· article· en· W3211873923 sur OpenAlexafffund
Mohammadali Tofighi, Ali Asgary, Asad A. Merchant, Mohammad Ali Shafiee, Mahdi M. Najafabadi, Nazanin Nadri, Mehdi Aarabi, Jane M. Heffernan

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensUniversity Health NetworkYork University
Organismes subventionnairesPublic Health AgencyPublic Health Agency of CanadaUniversity Health Network
Mots-clésDialysisHemodialysisPandemicTransmission (telecommunications)Scale (ratio)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)Renal replacement therapyEnd stage renal diseaseIntensive care medicineMedicineDisease transmissionComputer scienceOutbreakSimulationDiseaseInternal medicineVirologyInfectious disease (medical specialty)Physics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The COVID-19 pandemic has been particularly threatening to patients with end-stage kidney disease (ESKD) on intermittent hemodialysis and their care providers. Hemodialysis patients who receive life-sustaining medical therapy in healthcare settings, face unique challenges as they need to be at a dialysis unit three or more times a week, where they are confined to specific settings and tended to by dialysis nurses and staff with physical interaction and in close proximity. Despite the importance and critical situation of the dialysis units, modelling studies of the SARS-CoV-2 spread in these settings are very limited. In this paper, we have used a combination of discrete event and agent-based simulation models, to study the operations of a typical large dialysis unit and generate contact matrices to examine outbreak scenarios. We present the details of the contact matrix generation process and demonstrate how the simulation calculates a micro-scale contact matrix comprising the number and duration of contacts at a micro-scale time step. We have used the contacts matrix in an agent-based model to predict disease transmission under different scenarios. The results show that micro-simulation can be used to estimate contact matrices, which can be used effectively for disease modelling in dialysis and similar settings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,168
Score d'incertitude au seuil0,638

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,485
Tête enseignante GPT0,407
Écart entre enseignants0,078 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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