The Mitochondrial Genomes of 18 New Pleurosticti (Coleoptera: Scarabaeidae) Exhibit a Novel trnQ-NCR-trnI-trnM Gene Rearrangement and Clarify Phylogenetic Relationships of Subfamilies within Scarabaeidae
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The availability of next-generation sequencing (NGS) in recent years has facilitated a revolution in the availability of mitochondrial (mt) genome sequences. The mt genome is a powerful tool for comparative studies and resolving the phylogenetic relationships among insect lineages. The mt genomes of phytophagous scarabs of the subfamilies Cetoniinae and Dynastinae were under-represented in GenBank. Previous research found that the subfamily Rutelinae was recovered as a paraphyletic group because the few representatives of the subfamily Dynastinae clustered into Rutelinae, but the subfamily position of Dynastinae was still unclear. In the present study, we sequenced 18 mt genomes from Dynastinae and Cetoniinae using next-generation sequencing (NGS) to re-assess the phylogenetic relationships within Scarabaeidae. All sequenced mt genomes contained 37 sets of genes (13 protein-coding genes, 22 tRNAs, and two ribosomal RNAs), with one long control region, but the gene order was not the same between Cetoniinae and Dynastinae species. All mt genomes of Dynastinae species showed the same gene rearrangement of trnQ-NCR-trnI-trnM, whereas all mt genomes of Cetoniinae species showed the ancestral insect gene order of trnI-trnQ-trnM. Phylogenetic analyses (IQ-tree and MrBayes) were conducted using 13 protein-coding genes based on nucleotide and amino acid datasets. In the ML and BI trees, we recovered the monophyly of Rutelinae, Cetoniinae, Dynastinae, and Sericinae, and the non-monophyly of Melolonthinae. Cetoniinae was shown to be a sister clade to (Dynastinae + Rutelinae).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle