Genetic diversity of Dengue virus serotypes circulating among Aedes mosquitoes in selected regions of northeastern Nigeria
Notice bibliographique
Résumé
The flaviviruses are mosquito borne pathogens that continue to pose a considerable public health risk to animals and humans. The members of this group includes, Dengue virus (DENV), Yellow fever virus (YVF), Japanese encephalitis virus (JEV), West Nile virus (WEV) and Zika virus (ZKV). The DENV mosquito vector is endemic to tropical and subtropical climates, placing ∼40% of the world's population at direct risk of dengue infection. Currently, in Nigeria the status of DENV serotypes circulating among mosquito vectors is unknown. Our study was designed to identify and characterize the DENV serotypes circulating in Aedes mosquito populations collected in selected sites in Nigeria. The mosquitoes were collected and identified morphologically to species level using colored identification keys of Rueda. Generally, each species identified was tested in pools of 20 individuals of each Aedes species. RT-PCR and semi nested PCR were used to detect DENV serotypes in mosquitoes and characterized using Sanger sequencing methods. The results showed that DENV serotypes were detected in 58.54% (24/41) of the pools of Aedes mosquitoes from Mubi, Numan and Yola screened. All DENV1-4 serotypes were detected in Ae. aegypti. While DENV 1, 2 and 4 were detected in Ae. albopictus. And only DENV 2 was detected in Ae. galloisi with DENV4 serotype being reported for the first time in Nigeria. DENV2 (37.8%) was the most detected serotypes, while double and triple co-infections of serotypes were detected in 24.4% of the pools. Phylogenetic analysis revealed a strong evolutionary relatedness of DENV serotypes in our study with that of South and Southeast Asia, North America, and other African countries. This is the first reports on the natural DENV serotypes co-infection among Aedes species pools in Nigeria, which can create possible interaction with other flaviviruses causing animal and human diseases. In addition, our study postulates the possible linkage between DENV serotypes infection and human febrile flu-like disease burden being experienced by host communities in northeastern Nigeria.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».