Notice bibliographique
Résumé
Conjugation of plasmids is widespread among bacteria and contributes to the spread of antibiotic resistance. In the natural environment, microorganisms predominantly exist in the form of biofilms or other bioaggregates, where they may be exposed to contaminants such as antibiotics, at subinhibitory concentrations. Bacterial cells in older biofilms have lower growth activity due to oxygen and nutrient limitation in the deeper layers of the biofilms. In batch culture, population growth eventually ceases during the stationary phase. Thus, the steady state of biofilms may resemble stationary growth phase cultures. Our objectives were to study (i) the effect of cell growth phases and (ii) subinhibitory and minimum inhibitory concentrations (MIC) of antibiotics on transconjugant formation in both batch cultures and biofilms. Additionally, (iii) the effect of variable nutrient concentrations on MIC was investigated and (iv) an optimization of RT-PCR method for the detection of traA gene (which encodes pilus biosynthesis) expression was carried out. To study the effect of cell growth phases on transconjugant formation, plate matings were carried out utilizing planktonic cultures grown to exponential or stationary phase of donor and recipient strains. The results showed that transconjugant abundance was the highest (20± 0.08%) when both plasmid donor and recipient cells were grown to the stationary phase. However, the growth phase of the donor did not seem to play a role in biofilms. When donor cells were harvested from either the exponential or stationary phase of growth, and inoculated into 24 h old recipient biofilms, there was no statistically significant difference between transconjugant abundance. A higher percentage of transconjugants was detected in plate matings when the donor was exposed to 0.5× minimum inhibitory concentration of gentamicin and additionally challenged with gentamicin at MIC. In biofilms, transconjugant formation was not enhanced when the donor cells were grown with 0.5× MIC gentamicin, and 0.5× MIC gentamicin was added to the biofilms. A decrease in nutrient concentration was associated with a decrease in the MIC. traA expression, detected using RT-PCR in plasmid donor cells grown to early exponential and late exponential phases did not coincide with an increase in transconjugants.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».