MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3212699738 · doi:10.1371/journal.pone.0258878

Proliferation, apoptosis and their regulatory protein expression in colorectal adenomas and serrated lesions

2021· article· en· W3212699738 sur OpenAlexaff
Jane C. Figueiredo, Michael N. Passarelli, Wei Wei, Dennis J. Ahnen, Jeffrey S. Morris, Lynda Corley, Trupti R. Mehta, Angela N. Bartley, Gail McKeown‐Eyssen, Robert S. Bresalier, Elizabeth L. Barry, Ajay Goel, Goretti Hernández Mesa, Stanley R. Hamilton, John A. Baron

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Screening and Detection
Établissements canadiensPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésSurvivinCyclin D1ApoptosisCancer researchCyclinTissue microarrayAdenomaPathologyBiologyLesionImmunohistochemistryMedicineCell cycle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Adenomas and serrated lesions represent heterogeneous sets of early precursors in the colorectum with varying malignant potential. They are often distinguished by their histopathologic differences, but little is known about potential differences in regulation of epithelial proliferation and apoptosis. METHODS: We conducted a protein expression analysis using tissue microarrays of 625 colorectal adenomas and 142 serrated lesions to determine potential differences in regulation of epithelial proliferation and apoptosis. We quantitated proliferation with Ki-67; apoptosis with activated caspase-3 (CASP3); up- and down-regulators of proliferation with cyclin D1, p16INK2, and p21Cip1; and apoptosis regulators with BAX, BCL2, and survivin. Linear mixed effects models and circos diagrams were used to determine relationships among expression and lesion characteristics. RESULTS: Adenomas had a significantly higher CASP-3 labeling index (LI) than serrated lesions, resulting in a lower net growth ratio (Ki-67 LI/activated CASP-3 LI, p-value<0.0001). Cyclin D1 LI, p16 LI and p21 LI were lower in adenomas compared to serrated lesions, while expression of both BCL2 and BAX were higher (p <0.001). Among adenomas, cyclin D1 LI and p16 LI levels increased with greater villous component, and the highest BAX expression was detected in adenomas larger than 2 cm (both p<0.0001). Right-sided adenomas had higher CASP3 LI than left colorectal adenomas (p = 0.008). Significant differences in cyclin D1 LI, p21 LI and survivin LI were also observed across histopathologic subtypes of serrated lesions. CONCLUSIONS: Our findings demonstrate different patterns of regulatory protein expression in adenomas than serrated lesions, especially involving apoptosis. ClinicalTrials.gov Identifier: NCT00272324.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,086
Score d'incertitude au seuil0,315

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetColorectal Cancer Screening and DetectionTravaux en français237 207