Whole-genome sequence analysis unveils different origins of European and Asiatic mouflon and domestication-related genes in sheep
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
The domestication and subsequent development of sheep are crucial events in the history of human civilization and the agricultural revolution. However, the impact of interspecific introgression on the genomic regions under domestication and subsequent selection remains unclear. Here, we analyze the whole genomes of domestic sheep and their wild relative species. We found introgression from wild sheep such as the snow sheep and its American relatives (bighorn and thinhorn sheep) into urial, Asiatic and European mouflons. We observed independent events of adaptive introgression from wild sheep into the Asiatic and European mouflons, as well as shared introgressed regions from both snow sheep and argali into Asiatic mouflon before or during the domestication process. We revealed European mouflons might arise through hybridization events between a now extinct sheep in Europe and feral domesticated sheep around 6000-5000 years BP. We also unveiled later introgressions from wild sheep to their sympatric domestic sheep after domestication. Several of the introgression events contain loci with candidate domestication genes (e.g., PAPPA2, NR6A1, SH3GL3, RFX3 and CAMK4), associated with morphological, immune, reproduction or production traits (wool/meat/milk). We also detected introgression events that introduced genes related to nervous response (NEURL1), neurogenesis (PRUNE2), hearing ability (USH2A), and placental viability (PAG11 and PAG3) into domestic sheep and their ancestral wild species from other wild species.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle