The Diversity Patterns of Rare to Abundant Microbial Eukaryotes Across a Broad Range of Salinities in a Solar Saltern
Notice bibliographique
Résumé
Solar salterns are excellent artificial systems for examining species diversity and succession along salinity gradients. Here, the eukaryotic community in surface water of a Korean solar saltern (30 to 380 practical salinity units) was investigated from April 2019 to October 2020 using Illumina sequencing targeting the V4 and V9 regions of 18S rDNA. A total of 926 operational taxonomic units (OTUs) and 1,999 OTUs were obtained with the V4 and V9 regions, respectively. Notably, most of the OTUs were microbial eukaryotes, and the high-abundance groups (> 5% relative abundance (RA), Alveolata, Stramenopila, Archaeplastida, and Opisthokonta) usually accounted for > 90% of the total cumulative read counts and > 80% of all OTUs. Moreover, the high-abundance Alveolata (larger forms) and Stramenopila (smaller forms) groups displayed a significant inverse relationship, probably due to predator-prey interactions. Most of the low-abundance (0.1-5% RA) and rare (< 0.1% RA) groups remained small portion during the field surveys. Taxonomic novelty (at < 90% sequence identity) was high in the Amoebozoa, Cryptista, Haptista, Rhizaria, and Stramenopila groups (69.8% of all novel OTUs), suggesting the presence of a large number of hidden species in hypersaline environments. Remarkably, the high-abundance groups had little overlap with the other groups, implying the weakness of rare-to-prevalent community dynamics. The low-abundance Discoba group alone temporarily became the high-abundance group, suggesting that it is an opportunistic group. Overall, the composition and diversity of the eukaryotic community in hypersaline environments may be persistently stabilized, despite diverse disturbance events.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».