MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3212938097 · doi:10.1182/blood-2021-152151

Differential Activation of V γ4V δ1 and V γ9V δ2 Cord Blood Derived Gamma Delta T Cells upon Exposure to EBV-Lcl and K562 Cells

2021· article· en· W3212938097 sur OpenAlexaff
Jeremy Wee Kiat Ng, Joey Lai, Tony Kiat Hon Lim, William Ying Khee Hwang, Shang Li, Connie J. Eaves, Yeow Tee Goh, Alice M.S. Cheung

Notice bibliographique

RevueBlood · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensTerry Fox Research InstituteBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyT-cell receptorK562 cellsT cellLeukemiaMolecular biologyCell biologyImmunologyImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Gamma-delta (γδ) T cells have emerged as a promising candidate for adoptive cellular immunotherapy. To harness and maximize the anti-leukemia properties of these cells, we sort to comprehensively profile the transcriptomic signatures and immune repertoire of in vitro expanded γδ T cell products. Given the reported diverse TCR γδ repertoire and naïve nature of γδ T cells found in human cord blood (CB γδ), we serially track the molecular and cellular changes in these cells upon activation in expansion cultures. Based on the established viral reactivities of γδ T cell as well as prior studies showing their cross reactivities against leukemia and cancer cells, we had previously shown that stimulating CB γδ with an irradiated EBV-LCL feeder cell-based rapid expansion protocol (REP) is capable of generating cell products with potent and specific cytotoxicity against human AML cells. In the present study, using single cell RNA sequencing (scRNA-seq) coupled with single cell TCR γδ repertoire analysis, we compared the transcription signatures between our REP expanded γδ T cell (REP γδ) and non-manipulated γδ T cells reported in literatures, showing the progressive acquisition of an adult PB derived γδ T cell (PB γδ)-like cell states. Time course analysis demonstrated complex T cell activation and maturation trajectories correlating with variable level of clonal induction throughout the course of in vitro expansion. At the end of expansion, the harvested REP γδ are predominantly of the V γ4V δ1 subtype. Nevertheless, upon exposing REP γδ to target leukemia cell line K562, outgrowth of other non-V γ4V δ1 as well as the semi-invariant V γ9V δ2 cells were observed. Taken together, our data shows that as CB γδ expand and differentiate in culture, they adopt an adult PB γδ-like program. More importantly, our data highlights the rich clonal composition of in vitro expanded CB γδ, with different clonotypes being variably activated upon exposure to different stimuli. Such characteristics can potentially overcome the challenges of cancer heterogeneity and cell persistence, with the potential of improving outcomes in cell immunotherapy. Disclosures No relevant conflicts of interest to declare.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBlood→Même sujetImmune Cell Function and Interaction→Travaux en français237 207→