The evolutionary history of the Caribbean magnolias (Magnoliaceae): Testing species delimitations and biogeographical hypotheses using molecular data
Notice bibliographique
Résumé
The Caribbean islands provide an ideal setting for studying biodiversity, given their complex geological and environmental history, and their historical and current geographical proximity to the American mainland. Magnolia, a flagship tree genus that has 15 endemic and threatened taxa (12 species and 3 subspecies) on the Caribbean islands, offers an excellent case study to empirically test Caribbean biogeographical hypotheses. We constructed phylogenetic hypotheses to: (1) reveal their evolutionary history, (2) test the current largely morphology-based classification and assess species limits, and (3) investigate major biogeographic hypotheses proposed for the region. Nuclear and chloroplast DNA sequence data of all 15 Caribbean Magnolia taxa are included, supplemented by a selection of American mainland species, and species representing most major clades of the Magnoliaceae family. We constructed phylogenetic hypotheses in a time-calibrated Bayesian framework, supplemented with haplotype network analyses and ancestral range estimations. Genetic synapomorphies in the studied markers confirm the species limits of 14 out of 15 morphologically recognizable Caribbean Magnolia taxa. There is evidence for four colonization events of Magnolia into the Caribbean from the American mainland, which most likely occurred by overwater dispersal, given age estimates of maximum 16 mya for their presence on the Caribbean islands.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».