Applications of the SR4G Transgenic Zebrafish Line for Biomonitoring of Stress-Disrupting Compounds: A Proof-of-Concept Study
Notice bibliographique
Résumé
Transgenic zebrafish models have been successfully used in biomonitoring and risk assessment studies of environmental pollutants, including xenoestrogens, pesticides, and heavy metals. We employed zebrafish larva (transgenic SR4G line) with a cortisol-inducible green fluorescence protein reporter (eGFP) as a model to detect stress responses upon exposure to compounds with environmental impact, including bisphenol A (BPA), vinclozolin (VIN), and fluoxetine (FLX). Cortisol, fluorescence signal, and mRNA levels of eGFP and 11 targeted genes were measured in a homogenized pool of zebrafish larvae, with six experimental replicates for each endpoint. Eleven targeted genes were selected according to their association with stress-axis and immediate early response class of genes. Hydrocortisone (CORT)and dexamethasone (DEX) were used as positive and negative controls, respectively. All measurements were done in two unstressed and stressed condition using standardized net handling as the stressor. A significant positive linear correlation between cortisol levels and eGFP mRNA levels was observed (r> 0.9). Based on eGFP mRNA levels in unstressed and stressed larvae two predictive models were trained (Random Forest and Logistic Regression). Both these models could correctly predict the blunted stress response upon exposure to BPA, VIN, FLX and the negative control, DEX. The negative predictive value (NPV) of these models were 100%. Similar NPV was observed when the predictive models trained based on the mRNA levels of the eleven assessed genes. Measurement of whole-body fluorescence intensity signal was not significant to detect blunted stress response. Our findings support the use of SR4G transgenic larvae as an in vivo biomonitoring model to screen chemicals for their stress-disrupting potentials. This is important because there is increasing evidence that brief exposures to environmental pollutants modify the stress response and critical coping behaviors for several generations.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».