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Enregistrement W3213162933 · doi:10.1101/2021.11.15.468715

Critical role of H3K27 methylation in cell fate determination of two cell lineages in male gametophyte

2021· preprint· en· W3213162933 sur OpenAlexfundno aff
Xiaorong Huang, Meng‐Xiang Sun

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesWuhan UniversityInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesÖsterreichischen Akademie der WissenschaftenInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésCell fate determinationBiologyGametophyteReprogrammingGameteMicrosporeCell biologyArabidopsisGermlineGeneticsCellBotanyPollenStamenGeneMutantSperm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract During angiosperm male gametogenesis, microspores divide to produce a vegetative cell (VC) and a male germline (MG), each with a distinct cell fate. How the MG cell/VC fate is determined remains largely unknown. Here, we report that H3K27me3 is essential for VC fate commitment and H3K27me3 erasure contributes to the MG cell fate initiation in male gametophyte of Arabidopsis . The VC-targeted H3K27me3 erasure disturbed the VC development and resulted in the VC fate shifting towards a gamete destination, which suggests that MG cells require H3K27me3 erasure for triggering the gamete cell fate. Multi-omics and cytologic analysis confirmed the occurrence of extensive cell identity transition due to H3K27me3 erasure. Therefore, we experimentally confirm that the MG cell/VC fate is epigenetically regulated. The H3K27 methylation plays a critical role in the guidance of MG cell/VC fate determination for pollen fertility in Arabidopsis . Our work also provides new evidences for two previous hypotheses that the germline cell fate is specified by the differential distribution of yet unknown determinant, and VC maintains the microspore’s default program, namely the H3K27me3 setting, whereas MG requires reprogramming.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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