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Enregistrement W3213968965 · doi:10.1371/journal.pone.0258400

Treatment selection using prototyping in latent-space with application to depression treatment

2021· article· en· W3213968965 sur OpenAlexaff
Akiva Kleinerman, Ariel Rosenfeld, David Benrimoh, Robert Fratila, Caitrin Armstrong, Joseph Mehltretter, Eliyahu Shneider, Amit Yaniv‐Rosenfeld, Jordan F. Karp, Charles F. Reynolds, Gustavo Turecki, Adam Kapelner

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2021
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueMental Health Research Topics
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesMinistry of Health, State of Israel
Mots-clésMajor depressive disorderComputer scienceCluster analysisMachine learningDepression (economics)Personalized medicineSelection (genetic algorithm)Artificial intelligencePsychologyData scienceMedicineBioinformaticsPsychiatryBiologyCognition

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Machine-assisted treatment selection commonly follows one of two paradigms: a fully personalized paradigm which ignores any possible clustering of patients; or a sub-grouping paradigm which ignores personal differences within the identified groups. While both paradigms have shown promising results, each of them suffers from important limitations. In this article, we propose a novel deep learning-based treatment selection approach that is shown to strike a balance between the two paradigms using latent-space prototyping. Our approach is specifically tailored for domains in which effective prototypes and sub-groups of patients are assumed to exist, but groupings relevant to the training objective are not observable in the non-latent space. In an extensive evaluation, using both synthetic and Major Depressive Disorder (MDD) real-world clinical data describing 4754 MDD patients from clinical trials for depression treatment, we show that our approach favorably compares with state-of-the-art approaches. Specifically, the model produced an 8% absolute and 23% relative improvement over random treatment allocation. This is potentially clinically significant, given the large number of patients with MDD. Therefore, the model can bring about a much desired leap forward in the way depression is treated today.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,019
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,019
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,164
Tête enseignante GPT0,410
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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