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Enregistrement W3214198091 · doi:10.1093/jn/nxab388

Body Composition and Metabolomics in the Alberta Physical Activity and Breast Cancer Prevention Trial

2021· article· en· W3214198091 sur OpenAlexafffundabout
Kathleen M. McClain, Christine M. Friedenreich, Charles E. Matthews, Joshua N. Sampson, David P. Check, Darren R. Brenner, Kerry S. Courneya, Rachel A. Murphy, Steven C. Moore

Notice bibliographique

RevueJournal of Nutrition · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of CalgaryUniversity of British ColumbiaAlberta Health Services
Organismes subventionnairesIntramural Research ProgramCanadian Institutes of Health ResearchAlberta Heritage Foundation for Medical ResearchCanada Research ChairsCanadian Cancer SocietyMichael Smith Health Research BCCanadian Breast Cancer Research Alliance
Mots-clésBreast cancerComposition (language)MedicineMetabolomicsPhysical activityInternal medicineOncologyCancerPhysiologyBiologyBioinformaticsPhysical therapy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Obesity is correlated with many biomarkers, but the extent to which these correlate with underlying body composition is poorly understood. OBJECTIVES: Our objectives were to 1) describe/compare distinct contributions of fat/lean mass with BMI-metabolite correlations and 2) identify novel metabolite biomarkers of fat/lean mass. METHODS: The Alberta Physical Activity and Breast Cancer Prevention Trial was a 2-center randomized trial of healthy, inactive, postmenopausal women (n = 304). BMI (in kg/m2) was calculated using weight and height, whereas DXA estimated fat/lean mass. Ultra-performance liquid chromatography and mass spectrometry measured relative concentrations of serum metabolite concentrations. We estimated partial Pearson correlations between 1052 metabolites and BMI, adjusting for age, smoking, and site. Fat mass index (FMI; kg/m2) and lean mass index (LMI; kg/m2) correlations were estimated similarly, with mutual adjustment to evaluate independent effects. RESULTS: Using a Bonferroni-corrected α level <4.75 × 10-5, we observed 53 BMI-correlated metabolites (|r| = 0.24-0.42). Of those, 21 were robustly correlated with FMI (|r| > 0.20), 25 modestly (0.10 ≤ |r| ≤ 0.20), and 7 virtually null (|r| < 0.10). Ten of 53 were more strongly correlated with LMI than with FMI. Examining non-BMI-correlated metabolites, 6 robustly correlated with FMI (|r| = 0.24-0.31) and 2 with LMI (r = 0.25-0.26). For these, correlations for fat and lean mass were in opposing directions compared with BMI-correlated metabolites, in which correlations were mostly in the same direction. CONCLUSIONS: Our results demonstrate how a thorough evaluation of the components of fat and lean mass, along with BMI, provides a more accurate assessment of the associations between body composition and metabolites than BMI alone. Such an assessment makes evident that some metabolites correlated with BMI predominantly reflect lean mass rather than fat, and some metabolites related to body composition are not correlated with BMI. Correctly characterizing these relations is important for an accurate understanding of how and why obesity is associated with disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,966
Score d'incertitude au seuil0,067

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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