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Enregistrement W3214844791 · doi:10.26443/mjm.v20i1.901

How should we present the epidemic curve for COVID-19?

2021· article· en· W3214844791 sur OpenAlexaffvenueabout
Jean‐Paul Soucy, Sarah A. Buchan, Kevin A. Brown

Notice bibliographique

RevueMcGill Journal of Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProxy (statistics)PandemicPublic healthMedicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Public health policyDemographyHealth policyStatisticsDiseaseSociologyInfectious disease (medical specialty)Pathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epidemic curves are used by decision makers and the public to infer the trajectory of the COVID-19 pandemic and to understand the appropriateness of response measures. Symptom onset date is commonly used to date incident cases on the epidemic curve in public health reports and dashboards; however, third-party trackers date cases by the date they were publicly reported by the public health authority. These two curves create very different impressions of epidemic progression. On April 1, 2020, the epidemic curve based on public reporting date for Ontario, Canada showed an accelerating epidemic, whereas the curve based on a proxy variable for symptom onset date showed a rapidly declining epidemic. This illusory downward trend is a feature of epidemic curves anchored using date variables earlier in time than the date a case was publicly reported, such as the symptom onset date. Delays between the onset of symptoms and the detection of a case by the public health authority mean that recent days will always have incomplete case data, creating a downward bias. Public reporting date is not subject to this bias and can be used to visualize real-time epidemic curves meant to inform the public and decision makers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,120
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,989
Score d'incertitude au seuil0,140

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,120
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0090,007
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0100,014
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0050,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0280,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,253
Tête enseignante GPT0,451
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomainePrésentation des résultats
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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