Time to Positive Culture Detection Predicts <i>Mycobacterium avium</i> Pulmonary Disease Severity and Treatment Initiation
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Rationale Additional biomarkers are needed to guide initiation of treatment for Mycobacterium avium pulmonary disease (Mav-PD). Time to positive sputum culture detection (TTP) may offer potential prognostic and monitoring value. Objectives To determine whether TTP is associated with infection severity and early treatment response in Mav-PD. Methods We undertook a retrospective cohort study of patients with two or more sputum cultures positive for M. avium, an “index” sputum M. avium isolate during 2015–2019, a computed tomographic scan within 6 months, and no treatment for at least 6 months before index sputum. TTP was estimated from the date of laboratory receipt of the specimen to the date of culture positivity confirmation. TTP was tested for association with markers of infection severity (Mav-PD, bronchiectasis, cavitary disease, treatment initiation by 3 and 6 months, and acid fast bacilli [AFB] smear) and treatment response using Mann-Whitney U, Spearman’s correlation coefficient, and Wilcoxon signed-rank tests. We explored a threshold TTP that could identify significant M. avium disease. Results We included 125 patients with mean (standard deviation) age 68.5 (12.5) years and 65% fulfilled disease criteria. Median TTP was 12 (interquartile range 10–15; range 6–44) days. TTP and AFB smear grade were negatively correlated (ρ −0.58; P < 0.001). TTP was associated with nontuberculous mycobacteria (NTM) disease (P = 0.03), AFB smear positivity (P < 0.001), and treatment initiation by 3 (P = 0.01) and 6 (P = 0.03) months. A threshold TTP of 10 days or less was associated with Mav-PD (80.6% vs. 58.4%; ð [95% confidence interval (CI)] 22.1% [5.6–38.6%]; P = 0.02), AFB smear positivity (83.3% vs. 20.2%, ð [95% CI] 63.1% [48.3–77.9%]; P < 0.001), treatment by 3 (38.9% vs. 13.5%; ð [95% CI] 25.4% [8.0–42.8%]; P = 0.003) and 6 (47.2% vs. 19.1%; ð [95% CI] 28.1% [9.9–46.4%]; P = 0.003) months. After 3 and 6 months of treatment, the median (interquartile range) change in TTP was 8 (1 undefined; P < 0.001) and 7 (0 undefined; P = 0.001) days, respectively. Conclusions TTP is associated with bacterial burden and infection severity and increases in response to treatment. A threshold of 10 days or less may be useful in predicting significant Mav-PD. As a readily available biomarker, further exploration of TTP is imperative.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».