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Enregistrement W3214905963 · doi:10.1371/journal.pntd.0009958

Trichinella spiralis: Knockdown of gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) results in the reduction of worm burden

2021· article· en· W3214905963 sur OpenAlexfundno aff
Fei Hong, Muhammad Ali‐ul‐Husnain Naqvi, Sana Zahra Naqvi, Lixin Xu, Xiaokai Song, Xiangrui Li, Ruofeng Yan

Notice bibliographique

RevuePLoS neglected tropical diseases · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParasitic Diseases Research and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPriority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education InstitutionsGovernment of Jiangsu ProvinceXinjiang Production and Construction CorpsNatural Science Foundation of Jiangsu ProvinceMcGill University
Mots-clésTrichinella spiralisInterferon gammaGene knockdownBiologyChemistryImmunologyBiochemistryHelminthsCytokineApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Trichinella spiralis is mammalian skeletal muscles parasite which may cause trichinellosis in animals and humans. Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) is a widespread superfamily which plays key role in processing and presentation of MHC class II restricted antigen by catalyzing disulfide bond reduction. There are no reports about GILT in T. spiralis. In present study, GILT from T. spiralis (Tsp-GILT) was cloned, analyzed by multiple-sequence alignment, and predicted by 3D structure model. Recombinant Tsp-GILT (about 46 kDa) was efficiently expressed in Escherichia coli and thiol reductase activity suggested that in acidic environment the addition of a reducing agent is needed. Soaking method was used to knockdown expression of Tsp-GILT using small interference RNA (siRNA). Immunofluorescence assay confirmed the transformation of siRNA into muscle larva (ML) and new born larva (NBL). Quantitative real time-PCR (QRT-PCR) analysis revealed that transcription level of Tsp-GILT mRNA can be up-regulated by stimulation of mouse IFN-γ and down-regulated by siRNA2 in vitro. NBLs soaked with siRNA2 showed 32.3% reduction in the generation of MLs. MLs soaked with siRNA2 showed 26.2% reduction in the next generation of MLs, but no significant effect was observed on adult worms or NBLs. These findings concluded that GILT may play important roles in the development of T. spiralis parasite.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,862
Score d'incertitude au seuil0,625

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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