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Enregistrement W3215312374 · doi:10.1186/s13024-021-00499-4

A panel of CSF proteins separates genetic frontotemporal dementia from presymptomatic mutation carriers: a GENFI study

2021· article· en· W3215312374 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular Neurodegeneration · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensMcGill UniversityDouglas Mental Health University InstituteUniversité LavalHealth Sciences CentreOccupational Cancer Research CentreMontreal Neurological Institute and HospitalUniversity of TorontoSunnybrook Health Science CentreWestern University
Organismes subventionnairesRobarts Research InstituteMedical Research CouncilDemensfondenStichting DioraphteUniversität UlmUniversità degli Studi di BresciaUniversidade de LisboaÅhlén-stiftelsenCentre National de la Recherche ScientifiqueUniversità degli Studi di FirenzeVetenskapsrådetStockholms Läns LandstingKU LeuvenFamiljen Erling-Perssons StiftelseUniversity Health NetworkHjärnfondenUniversidade de CoimbraUniversity of TorontoNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekEberhard Karls Universität TübingenKing's College LondonZonMwKarolinska InstitutetSunnybrook Research InstituteEU Joint Programme – Neurodegenerative Disease ResearchInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleKungliga Tekniska HögskolanErasmus Medisch CentrumBrain Research UKBundesministerium für Bildung und ForschungLudwig-Maximilians-Universität MünchenNational Institute for Health and Care ResearchSorbonne UniversitéUniversità degli Studi di MilanoMcGill UniversityFondazione I.R.C.C.S. Istituto Neurologico Carlo BestaStiftelsen för Gamla Tjänarinnor
Mots-clésFrontotemporal dementiaC9orf72MutationDementiaPathologicalMedicineBiologyBioinformaticsPathologyGeneticsDiseaseGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: A detailed understanding of the pathological processes involved in genetic frontotemporal dementia is critical in order to provide the patients with an optimal future treatment. Protein levels in CSF have the potential to reflect different pathophysiological processes in the brain. We aimed to identify and evaluate panels of CSF proteins with potential to separate symptomatic individuals from individuals without clinical symptoms (unaffected), as well as presymptomatic individuals from mutation non-carriers. METHODS: A multiplexed antibody-based suspension bead array was used to analyse levels of 111 proteins in CSF samples from 221 individuals from families with genetic frontotemporal dementia. The data was explored using LASSO and Random forest. RESULTS: When comparing affected individuals with unaffected individuals, 14 proteins were identified as potentially important for the separation. Among these, four were identified as most important, namely neurofilament medium polypeptide (NEFM), neuronal pentraxin 2 (NPTX2), neurosecretory protein VGF (VGF) and aquaporin 4 (AQP4). The combined profile of these four proteins successfully separated the two groups, with higher levels of NEFM and AQP4 and lower levels of NPTX2 in affected compared to unaffected individuals. VGF contributed to the models, but the levels were not significantly lower in affected individuals. Next, when comparing presymptomatic GRN and C9orf72 mutation carriers in proximity to symptom onset with mutation non-carriers, six proteins were identified with a potential to contribute to a separation, including progranulin (GRN). CONCLUSION: In conclusion, we have identified several proteins with the combined potential to separate affected individuals from unaffected individuals, as well as proteins with potential to contribute to the separation between presymptomatic individuals and mutation non-carriers. Further studies are needed to continue the investigation of these proteins and their potential association to the pathophysiological mechanisms in genetic FTD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,489
Score d'incertitude au seuil0,767

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle