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Enregistrement W3215361303 · doi:10.1038/s41598-021-02626-z

Site specific incidence rate of virulence related genes of enteroaggregative Escherichia coli and association with enteric inflammation and growth in children

2021· article· en· W3215361303 sur OpenAlexfundno aff
Rina Das, Parag Palit, Md. Ahshanul Haque, Mustafa Mahfuz, A. S. G. Faruque, Tahmeed Ahmed

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueChild Nutrition and Water Access
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthFogarty International CenterInternational Centre for Diarrhoeal Disease Research, BangladeshUniversity of VendaTribhuvan UniversityGlobal Affairs CanadaBill and Melinda Gates FoundationJohns Hopkins UniversityChristian Medical College, VelloreIndian Council of Medical Research
Mots-clésEnteroaggregative Escherichia coliIncidence (geometry)BiologyPoisson regressionDiarrheaVirulenceMedicineMicrobiologyGeneVeterinary medicineEscherichia coliInternal medicineEnterobacteriaceaeGeneticsEnvironmental healthPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is a lack of information highlighting the possible association between strain carrying genes of enteroaggregative Escherichia coli (EAEC) and environmental enteric dysfunction (EED) and on linear growth during childhood. Strain carrying genes of EAEC from stool samples collected from 1705 children enrolled in the MAL-ED birth cohort were detected by TaqMan Array Cards. We measured site-specific incidence rate by using Poisson regression models, identified the risk factors and estimated the associations of strain carrying genes of EAEC with the composite EED score and linear growth at 24 months of age. Overall highest incidence rate (43.3%) was found among children having infection with the aggR gene, which was the greatest in Tanzania (56.7%). Low maternal education, lack of improved floor, and ownership of domestic cattle were found to be risk factors for EAEC infection. In the multivariate models, after adjusting the potential covariates, strain carrying genes of EAEC showed strong positive associations with the EED scores and with poor linear growth at 24 months of age. Our analyses may lay the cornerstone for a prospective epidemiologic investigation for a potential vaccine development aimed at reducing the burden of EAEC infections and combat childhood malnutrition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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