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Enregistrement W3215497431 · doi:10.1002/edn3.404

Environmental <scp>DNA</scp> survey of the Winter Salmonosphere in the Gulf of Alaska

2023· article· en· W3215497431 sur OpenAlexafffund
Christoph Deeg, Shaorong Li, Svetlana Esenkulova, Brian P. V. Hunt, Angela D. Schulze, Kristina M. Miller

Notice bibliographique

RevueEnvironmental DNA · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensTula FoundationFisheries and Oceans CanadaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans CanadaPacific Salmon FoundationMitacs
Mots-clésPredationFisheryMarine ecosystemOceanographyEcosystemApex predatorBiologyEcologyGeographyGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pacific salmon ( Oncorhynchus spp.) are a foundation species around the north Pacific, yet many wild populations have experienced steep declines over the last decades associated with decreased marine survival. Due to limited sampling, our understanding of the dynamic North Pacific Ocean ecosystem remains poor and factors impacting marine survival of salmon remain largely unknown, specifically in the winter when salmon face limited resources. Here, we present a late winter ecosystem‐wide environmental DNA (eDNA) survey performed in 2019 and 2020 in the Gulf of Alaska. Our eDNA data refines the ocean distribution and relative abundance of Pacific salmon, as well as their prey such as copepods. Vertical diurnal migrators like myctophids and squid that are prey and/or competitors of salmon and represent the bulk of the open ocean biomass in the Gulf of Alaska. We detected these species irrespective of time of day in the eDNA data, resolving the nighttime bias associated with trawl catches. Furthermore, eDNA uncovered cryptic predators of salmon such as salmon sharks ( Lamna ditropis ) and beaked whales ( Ziphiidae ) not evident from catch or observer data. Open‐ocean communities of the central Gulf of Alaska were characterized by low species richness in contrast to hotspots of biological activity associated with oceanographic features such as eddies and the continental shelf. Network analysis revealed the ecological interactions that salmon navigate in the open‐ocean ecosystem by identifying key prey species, competitors, and predators and revealed the negative impact of the northern sea nettle ( Chrysaora melanaster ) on salmon that was associated with a marine heatwave in 2019. Finally, we highlight the utility of eDNA for open ocean ecosystem research and provide recommendations for further surveys. This dataset, complementing traditional survey methods, illustrates the winter salmonosphere in the North Pacific Ocean at improved resolution and provides a baseline for future research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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