Accuracy of genomic selection for reducing susceptibility to pendulous crop in turkey (Meleagris gallopavo)
Notice bibliographique
Résumé
Pendulous crop (PC) in the turkey occurs when the crop distends from its normal position, thereby preventing the movement of feed and water from the crop down into the digestive system. This condition negatively impacts the turkey industry at both production and welfare levels. In this study, we estimated the genetic parameters for PC incidence and its genetic correlation with 5 production traits. Additionally, we evaluated the prediction accuracy and bias of breeding values for the selection candidates using pedigree (BLUP) or pedigree-genomic (ssGBLUP) relationships among the animals. A total of 245,783 turkey records were made available by Hybrid Turkeys, Kitchener, Canada. Of these, 6,545 were affected with PC. In addition, the data included 9,634 records for breast meat yield (BMY); 5,592 records for feed conversion ratio (FCR) and residual feed intake (RFI) in males; 170,844 records for body weight (BW) and walking score (WS) between 18 and 20 wk of age for males (71,012) and females (99,832), respectively. Among this population, 36,830 were genotyped using a 65K SNP Illumina Inc. chip. While all animals passed the quality control criteria, only 53,455 SNP markers were retained for subsequent analysis. Heritability for PC was estimated at 0.16 ± 0.00 and 0.17 ± 0.00 using BLUP and ssGBLUP, respectively. The incidence of PC was not genetically correlated with WS or FCR. Low unfavourable genetic correlations with BW (0.12 and 0.14), BMY (0.24 and 0.24) and RFI (-0.33 and -0.28) were obtained using BLUP and ssGBLUP, respectively. Using ssGBLUP showed higher prediction accuracy (0.51) for the breeding values for the selection candidates than the pedigree-based model (0.35). Whereas the bias of the prediction was slightly reduced with ssGBLUP (0.33 ± 0.05) than BLUP (0.30 ± 0.08), both models showed a regression coefficient lower than one, indicating inflation in the predictions. The results of this study suggest that PC is a heritable trait and selection for lower PC incidence rates is feasible. Although further investigation is necessary, selection for BW, BMY, and RFI may increase PC incidence. Incorporating genomic information would lead to higher accuracy in predicting the genetic merit for selection candidates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».