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Enregistrement W3215651941 · doi:10.1371/journal.ppat.1010116

VgrG-dependent effectors and chaperones modulate the assembly of the type VI secretion system

2021· article· en· W3215651941 sur OpenAlexfundno aff
Xiaoye Liang, Tong‐Tong Pei, Hao Li, Hao‐Yu Zheng, Han Luo, Yang Cui, Ming‐Xuan Tang, Yajie Zhao, Ping Xu, Tao Dong

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Natural Science Foundation of ChinaCanada Research Chairs
Mots-clésEffectorType VI secretion systemChaperone (clinical)SecretionCell biologyBiologyMicrobiologyChemistryGeneGeneticsVirulenceBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The type VI secretion system (T6SS) is a spear-like nanomachine found in gram-negative pathogens for delivery of toxic effectors to neighboring bacterial and host cells. Its assembly requires a tip spike complex consisting of a VgrG-trimer, a PAAR protein, and the interacting effectors. However, how the spike controls T6SS assembly remains elusive. Here we investigated the role of three VgrG-effector pairs in Aeromonas dhakensis strain SSU, a clinical isolate with a constitutively active T6SS. By swapping VgrG tail sequences, we demonstrate that the C-terminal ~30 amino-acid tail dictates effector specificity. Double deletion of vgrG1&2 genes (VgrG3+) abolished T6SS secretion, which can be rescued by ectopically expressing chimeric VgrG3 with a VgrG1/2-tail but not the wild type VgrG3. In addition, deletion of effector-specific chaperones also severely impaired T6SS secretion, despite the presence of intact VgrG and effector proteins, in both SSU and Vibrio cholerae V52. We further show that SSU could deliver a V. cholerae effector VasX when expressing a plasmid-borne chimeric VgrG with VasX-specific VgrG tail and chaperone sequences. Pull-down analyses show that two SSU effectors, TseP and TseC, could interact with their cognate VgrGs, the baseplate protein TssK, and the key assembly chaperone TssA. Effectors TseL and VasX could interact with TssF, TssK and TssA in V. cholerae. Collectively, we demonstrate that chimeric VgrG-effector pairs could bypass the requirement of heterologous VgrG complex and propose that effector-stuffing inside the baseplate complex, facilitated by chaperones and the interaction with structural proteins, serves as a crucial structural determinant for T6SS assembly.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil0,220

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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