Update and Evaluation of a High-Throughput In Vitro Mass Balance Distribution Model: IV-MBM EQP v2.0
Notice bibliographique
Résumé
This study demonstrates the utility of an updated mass balance model for predicting the distribution of organic chemicals in in vitro test systems (IV-MBM EQP v2.0) and evaluates its performance with empirical data. The IV-MBM EQP v2.0 tool was parameterized and applied to four independent data sets with measured ratios of bulk medium or freely-dissolved to initial nominal concentrations (e.g., C24/C0 where C24 is the measured concentration after 24 h of exposure and C0 is the initial nominal concentration). Model performance varied depending on the data set, chemical properties (e.g., “volatiles” vs. “non-volatiles”, neutral vs. ionizable organics), and model assumptions but overall is deemed acceptable. For example, the r2 was greater than 0.8 and the mean absolute error (MAE) in the predictions was less than a factor of two for most neutral organics included. Model performance was not as good for the ionizable organic chemicals included but the r2 was still greater than 0.7 and the MAE less than a factor of three. The IV-MBM EQP v2.0 model was subsequently applied to several hundred chemicals on Canada’s Domestic Substances List (DSL) with nominal effects data (AC50s) reported for two in vitro assays. We report the frequency of chemicals with AC50s corresponding to predicted cell membrane concentrations in the baseline toxicity range (i.e., >20–60 mM) and tabulate the number of chemicals with “volatility issues” (majority of chemical in headspace) and “solubility issues” (freely-dissolved concentration greater than water solubility after distribution). In addition, the predicted “equivalent EQP blood concentrations” (i.e., blood concentration at equilibrium with predicted cellular concentration) were compared to the AC50s as a function of hydrophobicity (log octanol-water partition or distribution ratio). The predicted equivalent EQP blood concentrations exceed the AC50 by up to a factor of 100 depending on hydrophobicity and assay conditions. The implications of using AC50s as direct surrogates for human blood concentrations when estimating the oral equivalent doses using a toxicokinetic model (i.e., reverse dosimetry) are then briefly discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».