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Enregistrement W3216541218 · doi:10.1002/pld3.360

Asymmetric distribution of extracellular matrix proteins in seed coat epidermal cells of Arabidopsis is determined by polar secretion

2021· article· en· W3216541218 sur OpenAlexafffund
Yi‐Chen Lee, Gillian H. Dean, Erin J. Gilchrist, Allen Yi‐Lun Tsai, George W. Haughn

Notice bibliographique

RevuePlant Direct · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistry of Education
Mots-clésMucilageApoplastCell biologyCell wallBiologyArabidopsis thalianaVacuoleSecretionArabidopsisTurgor pressureBiophysicsExtracellularBiochemistryCytoplasmChemistryBotanyMutantGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Although asymmetric deposition of the plant extracellular matrix is critical for the normal functioning of many cell types, the molecular mechanisms establishing this asymmetry are not well understood. During differentiation, Arabidopsis seed coat epidermal cells deposit large amounts of pectin‐rich mucilage asymmetrically to form an extracellular pocket between the plasma membrane and the outer tangential primary cell wall. At maturity, the mucilage expands on contact with water, ruptures the primary cell wall, and extrudes to encapsulate the seed. In addition to polysaccharides, mucilage contains secreted proteins including the β‐galactosidase MUCILAGE MODIFIED 2 (MUM2). A functional chimeric protein where MUM2 was fused translationally with Citrine yellow fluorescent protein (Citrine) indicated that MUM2‐Citrine fluorescence preferentially accumulates in the mucilage pocket concomitant with mucilage deposition and rapidly disappears when mucilage synthesis ceases. A secreted form of Citrine, secCitrine, showed a similar pattern of localization when expressed in developing seed coat epidermal cells. This result suggested that both the asymmetric localization and rapid decrease of fluorescence is not unique to MUM2‐Citrine and may represent the default pathway for secreted proteins in this cell type. v ‐SNARE proteins were localized only in the membrane adjacent to the mucilage pocket, supporting the hypothesis that the cellular secretory apparatus is redirected and targets secretion to the outer periclinal apoplast during mucilage synthesis. In addition, mutation of ECHIDNA , a gene encoding a TGN‐localized protein involved in vesicle targeting, causes misdirection of mucilage, MUM2 and v ‐SNARE proteins from the apoplast/plasma membrane to the vacuole/tonoplast. Western blot analyses suggested that the disappearance of MUM2‐Citrine fluorescence at the end of mucilage synthesis is due to protein degradation and because several proteases have been identified in extruded seed mucilage. However, as mutation of these genes did not result in a substantial delay in MUM2‐Citrine degradation and the timing of their expression and/or their intracellular localization were not consistent with a role in MUM2‐Citrine disappearance, the mechanism underlying the abrupt decrease of MUM2‐Citrine remains unclear.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,631

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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