A systematic review of GWAS identified SNPs associated with outcomes of medications for opioid use disorder
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Patients with opioid use disorder (OUD) display an interindividual variability in their response to medications for opioid use disorder (MOUD). A genetic basis may explain the variability in this response. However, no consensus has been reached regarding which genetic variants significantly contribute to MOUD outcomes. OBJECTIVES: This systematic review aims to summarize genome-wide significant findings on MOUD outcomes and critically appraise the quality of the studies involved. METHODS: Databases searched from inception until August 21st, 2020 include: MEDLINE, Web of Science, EMBASE, CINAHL and Pre-CINAHL, GWAS Catalog and GWAS Central. The included studies had to be GWASs that assessed MOUD in an OUD population. All studies were screened in duplicate. The quality of the included studies was scored and assessed using the Q-Genie tool. Quantitative analysis, as planned in the protocol, was not feasible, so the studies were analyzed qualitatively. RESULTS: . In total, 43 genetic variants were identified. Variants corresponding to CNIH3 were reported to be associated with daily heroin injection in Europeans, OPRM1, TRIB2, and ZNF146 with methadone dose in African Americans, EYS with methadone dose in Europeans, and SPON1 and intergenic regions in chromosomes 9 and 3 with plasma concentrations of S-methadone, R-methadone, and R-EDDP, respectively, in Han Chinese. LIMITATIONS: The limitations of this study include not being able to synthesize the data in a quantitative way and a conservative eligibility and data collection model. CONCLUSION: The results from this systematic review will aid in highlighting significant genetic variants that can be replicated in future OUD pharmacogenetics research to ascertain their role in patient-specific MOUD outcomes. Systematic review registration number CRD42020169121.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,010 | 0,045 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,009 | 0,009 |
| Bibliométrie | 0,015 | 0,021 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».