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Enregistrement W3217073332 · doi:10.1186/s12889-021-11891-6

Using GAM functions and Markov-Switching models in an evaluation framework to assess countries’ performance in controlling the COVID-19 pandemic

2021· article· en· W3217073332 sur OpenAlexaff
Abdinardo Moreira Barreto de Oliveira, Jane M. Binner, Anandadeep Mandal, Logan Kelly, Gabriel J. Power

Notice bibliographique

RevueBMC Public Health · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiostatisticsDeviance information criterionPandemicCoronavirus disease 2019 (COVID-19)EconometricsMarkov chainMarkov modelStatisticsPublic healthMathematicsMedicineMarkov chain Monte CarloBayesian probability

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The COVID-19 pandemic has initiated several initiatives to better understand its behavior, and some projects are monitoring its evolution across countries, which naturally leads to comparisons made by those using the data. However, most "at a glance" comparisons may be misleading because the curve that should explain the evolution of COVID-19 is different across countries, as a result of the underlying geopolitical or socio-economic characteristics. Therefore, this paper contributes to the scientific endeavour by creating a new evaluation framework to help stakeholders adequately monitor and assess the evolution of COVID-19 in countries, considering the occurrence of spikes, "secondary waves" and structural breaks in the time series. METHODS: Generalized Additive Models were used to model cumulative and daily curves for confirmed cases and deaths. The Root Relative Squared Error and the Percentage Deviance Explained measured how well the models fit the data. A local min-max function was used to identify all local maxima in the fitted values. The pure Markov-Switching and the family of Markov-Switching GARCH models were used to identify structural breaks in the COVID-19 time series. Finally, a quadrants system to identify countries that are more/less efficient in the short/long term in controlling the spread of the virus and the number of deaths was developed. Such methods were applied in the time series of 189 countries, collected from the Centre for Systems Science and Engineering at Johns Hopkins University. RESULTS: Our methodology proves more effective in explaining the evolution of COVID-19 than growth functions worldwide, in addition to standardizing the entire estimation process in a single type of function. Besides, it highlights several inflection points and regime-switching moments, as a consequence of people's diminished commitment to fighting the pandemic. Although Europe is the most developed continent in the world, it is home to most countries with an upward trend and considered inefficient, for confirmed cases and deaths. CONCLUSIONS: The new outcomes presented in this research will allow key stakeholders to check whether or not public policies and interventions in the fight against COVID-19 are having an effect, easily identifying examples of best practices and promote such policies more widely around the world.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,046
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,064
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,046
Score d'incertitude au seuil0,241

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0460,064
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0070,003
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0050,004
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,672
Tête enseignante GPT0,531
Écart entre enseignants0,142 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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