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Enregistrement W3217105868 · doi:10.3389/fninf.2021.622951

Magnetic Resonance Imaging Sequence Identification Using a Metadata Learning Approach

2021· article· en· W3217105868 sur OpenAlex
Shuai Liang, Derek Beaton, Stephen R. Arnott, Tom Gee, Mojdeh Zamyadi, Robert Bartha, Sean Symons, Glenda MacQueen, Stefanie Hassel, Jason P. Lerch, Evdokia Anagnostou, Raymond W. Lam, Benício N. Frey, Roumen Milev, Daniel J. Müller, Sidney H. Kennedy, Christopher J.M. Scott

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Neuroinformatics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensHeart and Stroke FoundationCentre for Addiction and Mental HealthQueen's UniversitySt. Joseph’s Healthcare HamiltonWestern UniversityUniversity of TorontoUniversity of British ColumbiaHospital for Sick ChildrenUniversity of CalgaryUniversity Health NetworkHealth Sciences CentreSt. Michael's HospitalSunnybrook Health Science CentreMcMaster UniversityRobarts Clinical TrialsIndoc ResearchHolland Bloorview Kids Rehabilitation HospitalBaycrest Hospital
Organismes subventionnairesFaculty of Health Sciences, Queen's UniversityNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaTemerty Family FoundationH. Lundbeck A/SServierUniversity of British ColumbiaLondon Health Sciences FoundationGovernment of OntarioUniversity of OttawaHospital for Sick ChildrenPfizerOntario Brain InstituteUniversity of CalgaryQueen's UniversityCanadian Institutes of Health ResearchCentre for Addiction and Mental Health FoundationMcMaster UniversityBristol-Myers Squibb
Mots-clésComputer scienceMetadataIdentification (biology)Artificial intelligenceMagnetic resonance imagingSequence (biology)Machine learningA priori and a posterioriSoftwareInformation retrievalData miningWorld Wide WebMedicineRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite the wide application of the magnetic resonance imaging (MRI) technique, there are no widely used standards on naming and describing MRI sequences. The absence of consistent naming conventions presents a major challenge in automating image processing since most MRI software require a priori knowledge of the type of the MRI sequences to be processed. This issue becomes increasingly critical with the current efforts toward open-sharing of MRI data in the neuroscience community. This manuscript reports an MRI sequence detection method using imaging metadata and a supervised machine learning technique. Three datasets from the Brain Center for Ontario Data Exploration (Brain-CODE) data platform, each involving MRI data from multiple research institutes, are used to build and test our model. The preliminary results show that a random forest model can be trained to accurately identify MRI sequence types, and to recognize MRI scans that do not belong to any of the known sequence types. Therefore the proposed approach can be used to automate processing of MRI data that involves a large number of variations in sequence names, and to help standardize sequence naming in ongoing data collections. This study highlights the potential of the machine learning approaches in helping manage health data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,775
Score d'incertitude au seuil0,518

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle